24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0734 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  194  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.12 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1288  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.53 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.93 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1766  CRISPR-associated protein Cas2  29.63 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.8 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1075  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.37 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1141  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.27 
 
 
90 aa  47.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.210554  hitchhiker  0.00000272687 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.67 
 
 
91 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.29 
 
 
96 aa  47  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.18 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  31.71 
 
 
90 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  29.27 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.91 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  29.67 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  26.25 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.5 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  34.21 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  30.85 
 
 
94 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3304  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.2 
 
 
85 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.63909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.82 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0577  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.05 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0715298  normal  0.0619602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.41 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>