76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2458 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  78.72 
 
 
94 aa  167  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  77.66 
 
 
94 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  65.96 
 
 
94 aa  140  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  47.73 
 
 
90 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  47.5 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.07 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.31 
 
 
94 aa  76.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.56 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.5 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  44.32 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.13 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  41.67 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.3 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.57 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  36.08 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  40.24 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  36.9 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.68 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.56 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  44.16 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.08 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.25 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  37.66 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  35.05 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  35.63 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  34.52 
 
 
97 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.17 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  34.52 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  40.85 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.25 
 
 
95 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.08 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  32.94 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.78 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  35.37 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  32.99 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.99 
 
 
96 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  34.88 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  42.59 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  35 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.96 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  32.56 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  40.38 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  30.93 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  32.56 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  32.18 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  39.44 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  29.9 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  28.74 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  35.11 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  47  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  43.48 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  32.29 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  34.88 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  34.72 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  36.99 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  30.38 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  36.62 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  42.42 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  37.31 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  37.31 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.53 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  30.12 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  30.85 
 
 
95 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  36.92 
 
 
98 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1801  CRISPR-associated protein Cas2  47.62 
 
 
94 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  43.59 
 
 
54 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.85 
 
 
104 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.11 
 
 
96 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  34.69 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.82 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.16 
 
 
95 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>