78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1397 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 87 aa  176  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.02 
 
 		 87 aa  76.6  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.86 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.43 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.19 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  45.35 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  41.86 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.02 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  50.75 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.02 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  39.76 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  40.7 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.7 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.7 
 
 		 87 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  40.7 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  38.2 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  38.37 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  37.21 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.06 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  41.86 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.56 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  39.74 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  47.54 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  38.37 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.66 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  42.42 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.9 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.24 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  37.66 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  31.33 
 
 		 91 aa  50.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.66 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.84 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  38.24 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  36.49 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  34.72 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  40.58 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  35.62 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  36.49 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  37.68 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.23 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  34.15 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  30.77 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6021  CRISPR-associated protein Cas2  34.57 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.088486  normal  0.298302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.82 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  42.19 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.94 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  32.18 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.4 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.18 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.47 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.44 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  29.73 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  29.89 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  32.56 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.23 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  37.68 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  32.43 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  35.21 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  26.51 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  30.95 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  30.77 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  30.99 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  32.39 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  26.51 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  38.78 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  37.88 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  29.73 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.39 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>