86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2484 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 93 aa  193  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  59.14 
 
 		 93 aa  120  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.43 
 
 		 93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  51.14 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  51.9 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  48.75 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.62 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  46.07 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  44.71 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.44 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.15 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.15 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  44.87 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.68 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.46 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  44.3 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  40.48 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  35.16 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  40 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  36.17 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  41.18 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.15 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.3 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  38.14 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.78 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  41.67 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.71 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  39.53 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  39.77 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  38.1 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  38.1 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  38.75 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  40.28 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  33.77 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  43.28 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.43 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  42.47 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  44.78 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.02 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.63 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  35.05 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.52 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  36.9 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  41.18 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  34.44 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.02 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  35.05 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  57.89 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  43.48 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  36.9 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  41.25 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  32.18 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.34 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  31.87 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.93 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  40.28 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.82 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  43.4 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  35.71 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  36.05 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.44 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.19 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.95 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.51 
 
 		 96 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.96 
 
 		 95 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.18 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.07 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1122  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.29 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00381279  normal  0.727583 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1276  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.07 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2281  CRISPR-associated protein Cas2  48.84 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>