37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0058 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0058  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 95 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.32 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  54.26 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  43.42 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  42.68 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  38.04 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  39.44 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  34.18 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.67 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.57 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  31.17 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  31.94 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  34.33 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  30.56 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  32.94 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  30.56 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  33.8 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.8 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.87 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  28.99 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  25.97 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  25.97 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  36.49 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.21 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  35.14 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  28.09 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.87 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.43 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.47 
 
 		 106 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.96 
 
 		 93 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  32.39 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.87 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.12 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  30.99 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  35.09 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.16 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  32.35 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>