70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3347 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  196  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  51.19 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  45.35 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  46.43 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.34 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  49.4 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  45.12 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  44.05 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  49.32 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  45.24 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  42.86 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.86 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.24 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  42.68 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  51.39 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.71 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  38.54 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  44.05 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.48 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  39.58 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  48.61 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  40.48 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.78 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  42.05 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.29 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.96 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  42.17 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  46.43 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.35 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.29 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  38.27 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3908  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48914  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.71 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.36 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.05 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.89 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  35.06 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1073  hypothetical protein  42.47 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0137603 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  37.68 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  32.14 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.44 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  37.65 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.63 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.05 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  30.38 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  41.57 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.1 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  36.05 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  31.25 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  27.96 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.22 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  25.53 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.24 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  32.86 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.58 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  32.58 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  26.88 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  34.85 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2357  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.27 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.97 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  35.59 
 
 		 109 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  30.49 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>