58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1876 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 91 aa  182  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  57.47 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  54.02 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  52.87 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.5 
 
 		 87 aa  90.1  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  51.16 
 
 		 87 aa  88.6  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.84 
 
 		 87 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.16 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  50 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  48.84 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  48.81 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.83 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.24 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  45 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  39.53 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  56.06 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  46.51 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.59 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.67 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  43.37 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  39.53 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  46.25 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  53.23 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  40.7 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.21 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.77 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.88 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  38.37 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.32 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.02 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  39.77 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  39.77 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.55 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  35.63 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.56 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  29.07 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  38.1 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  32.5 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  30.21 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.3 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  33.72 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  32.31 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  34.33 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  33.71 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  36.62 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  31.18 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  30.21 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  36.99 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.62 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  31.58 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  38.89 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  26.97 
 
 		 99 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  27.59 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  27.59 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  34.09 
 
 		 92 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.07 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  35.82 
 
 		 96 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>