88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1189 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 87 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  93.1 
 
 		 87 aa  170  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  67.82 
 
 		 87 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  68.97 
 
 		 87 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  65.12 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  63.22 
 
 		 87 aa  114  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  62.07 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  61.63 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  61.45 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  58.14 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  61.25 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  59.3 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  55.81 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  63.64 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  54.02 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  55.17 
 
 		 87 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  52.33 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.68 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  49.43 
 
 		 87 aa  83.6  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  48.75 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  53.75 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  40.23 
 
 		 87 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  56.96 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.65 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  43.02 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.83 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.53 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  44.3 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.53 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.68 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.24 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.86 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  43.18 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.62 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  42.11 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  43.42 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  41.56 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  37.23 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  36.59 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  38.3 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  37.18 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  39.74 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  36.25 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  33.71 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  35.29 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  34.12 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  36.56 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  32.18 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  34.83 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  35 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  31.88 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  37.88 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.09 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  33.71 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  31.76 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  29.55 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  32.58 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  35.82 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  31.94 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  37.5 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  34.21 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  29.21 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  30.53 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.62 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.18 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  30.34 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  37.31 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.85 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.46 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 96 aa  42  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.92 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.34 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  29.41 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  29.41 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  31.43 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3326  CRISPR-associated protein Cas2  32.53 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>