73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0347 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0347  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 86 aa  170  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0273659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0542  CRISPR-associated Cas2 family protein  63.22 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2316  CRISPR-associated Cas2 family protein  66.27 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3930  CRISPR-associated protein Cas2  60.92 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  63.64 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2658  CRISPR-associated protein Cas2  62.5 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0943  CRISPR-associated Cas2 family protein  61.25 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.932067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  63.64 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4285  CRISPR-associated protein Cas2  61.45 
 
 		 87 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2515  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.87 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.820712  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2013  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.28 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2296  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.16 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0123503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1629  CRISPR-associated protein Cas2  45.35 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0391307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0669  CRISPR-associated protein Cas2  51.81 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1650  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.85 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.405387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  53.75 
 
 		 87 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1810  CRISPR-associated Cas2 family protein  49.4 
 
 		 87 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0618  CRISPR-associated protein Cas2  48.24 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1876  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.67 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1024  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.81 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2431  CRISPR-associated protein Cas2  45.98 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0446  CRISPR-associated protein Cas2  43.02 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1448  CRISPR-associated protein Cas2  39.53 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2021  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.83 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0917  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.68 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0920  CRISPR-associated protein Cas2  39.56 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827801 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0674  CRISPR-associated protein Cas2  44.32 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0938  CRISPR-associated protein Cas2  39.74 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1393  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.59 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.51 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2839  CRISPR-associated protein Cas2  35.44 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.230646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1018  CRISPR-associated protein Cas2  45 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1288  CRISPR-associated protein Cas2  40.7 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.566019  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1081  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.78 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0998  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.77 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0304  hypothetical protein  36.78 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00258543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1128  hypothetical protein  41.56 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0768815  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1424  CRISPR-associated protein Cas2  39.53 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.183922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2002  CRISPR-associated protein Cas2  46.48 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1726  hypothetical protein  37.36 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.828783 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1397  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.9 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1396  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.97 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0256  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.62 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1802  hypothetical protein  48.08 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2999  CRISPR-associated protein Cas2  37.7 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0069107  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0904  CRISPR-associated protein Cas2  38.64 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216718  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3326  CRISPR-associated protein Cas2  32.94 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  31.46 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  38.55 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  37.35 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  31.76 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  33.73 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0636  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.05 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0150918  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0393  CRISPR-associated protein Cas2  35.29 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0694049  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.57 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1231  CRISPR-associated protein Cas2  36.23 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  32.14 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0666  CRISPR-associated protein Cas2  35.59 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  33.73 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0773  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.5 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.294628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3219  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.27 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180403  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0650  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.23 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0910876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  36.62 
 
 		 97 aa  42  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  37.35 
 
 		 96 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  34.12 
 
 		 96 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  33.73 
 
 		 99 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2721  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.58 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0228  CRISPR-associated Cas2 family protein  35 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  33.73 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.71 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  32.88 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>