More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0782 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 334 aa  662    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4768  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  25.87 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  24.17 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  24.27 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  25.31 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1705  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.860748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.13 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.73 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.84 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.25 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2034  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.56 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4376  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.349604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4144  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.473768 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4697  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.715091  normal  0.20048 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0461  multidrug/cation efflux pump  27.8 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  30.43 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2114  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  23.68 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  22.26 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.42 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.92 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1418  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267918  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0718692  normal  0.0182823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2674  secretion protein HlyD family protein  32.91 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0130408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2397  secretion protein HlyD family protein  32.5 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.689244  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  23.18 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0045  RND family efflux transporter MFP subunit  23.69 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  29.58 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  27.37 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  26.67 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.81 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.81 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2287  RND family efflux transporter MFP subunit  27.17 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  25.9 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.53 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  22.28 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  33.33 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  22.57 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.18 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.92 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.51 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  22.83 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  22.54 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2356  secretion protein HlyD family protein  31.1 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  22.93 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  22.93 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1704  secretion protein HlyD  27.37 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000161104  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  23.53 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  26.83 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1393  RND family efflux transporter MFP subunit  24.84 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  28.3 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  26.9 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  28.11 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  23.89 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  20.55 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.54 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  37.5 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.7 
 
 		 378 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  21.24 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.38 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2973  RND family efflux transporter MFP subunit  25.35 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.388324  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  29.31 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  29.31 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000654  putative efflux protein  24.46 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>