More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0327 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0327  diguanylate cyclase  100 
 
 
295 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.33 
 
 
438 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.67 
 
 
503 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1917  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  44 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0589316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.84 
 
 
880 aa  162  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.84 
 
 
860 aa  162  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  48.52 
 
 
420 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3356  GGDEF domain/HAMP domain-containing protein  48.26 
 
 
533 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.204674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0429  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  49.09 
 
 
431 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.94 
 
 
431 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  47.02 
 
 
960 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.94 
 
 
431 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.48 
 
 
853 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  44.25 
 
 
836 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  44.38 
 
 
474 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.03 
 
 
593 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.95 
 
 
425 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  47.13 
 
 
434 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  40.1 
 
 
619 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2051  diguanylate cyclase  43.53 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.04 
 
 
755 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  42.94 
 
 
526 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.08 
 
 
623 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
465 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  41.34 
 
 
803 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.43 
 
 
909 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1892  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.89 
 
 
771 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 
912 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.26 
 
 
1338 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.61 
 
 
971 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.86 
 
 
681 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.61 
 
 
616 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6017  diguanylate cyclase  41.18 
 
 
487 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.98 
 
 
814 aa  125  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0422  diguanylate cyclase  34.68 
 
 
317 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2462  PAS:GGDEF  35.89 
 
 
489 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.35 
 
 
719 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 
483 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1857  diguanylate cyclase  41.51 
 
 
490 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.04 
 
 
746 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1745  diguanylate cyclase  38.69 
 
 
495 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0113833  normal  0.32782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4938  diguanylate cyclase  38.79 
 
 
492 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0911189  normal  0.262265 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0758  diguanylate cyclase  34.15 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3602  diguanylate cyclase  37.35 
 
 
490 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.921669 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4679  diguanylate cyclase  37.35 
 
 
490 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.882516  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  34.94 
 
 
599 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 
539 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  39.16 
 
 
451 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1797  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.35 
 
 
324 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.504833  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3012  diguanylate cyclase  37.8 
 
 
428 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000172152  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3660  hypothetical protein  37.5 
 
 
491 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.165778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  37.95 
 
 
343 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0504  GGDEF domain-containing protein  33.67 
 
 
385 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0508  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40 
 
 
917 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0729931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0495  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40 
 
 
907 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.128556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3474  diguanylate cyclase  39.51 
 
 
393 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0867  diguanylate cyclase  36.84 
 
 
492 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  40.57 
 
 
617 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3237  diguanylate cyclase  35 
 
 
286 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1895  diguanylate cyclase  48.65 
 
 
515 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.175233  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0028  diguanylate cyclase  34.34 
 
 
434 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4922  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.45 
 
 
617 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.051397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  39.74 
 
 
457 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1164  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  31.66 
 
 
599 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0260621  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3344  PAS sensor diguanylate cyclase  37.58 
 
 
490 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2995  diguanylate cyclase  37.58 
 
 
490 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.31 
 
 
469 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  39.47 
 
 
294 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0735  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.79 
 
 
347 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  37.2 
 
 
321 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  34.44 
 
 
385 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  34.44 
 
 
385 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5335  diguanylate cyclase  37.35 
 
 
489 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  40.4 
 
 
457 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4747  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.02 
 
 
623 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.311394  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3313  diguanylate cyclase  35.54 
 
 
481 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4833  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.02 
 
 
623 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0588  hypothetical protein  40.85 
 
 
903 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3968  diguanylate cyclase  34.44 
 
 
385 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.88 
 
 
520 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5133  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.02 
 
 
623 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.582913  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.24 
 
 
866 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.378784  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.85 
 
 
769 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  38.41 
 
 
457 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5179  diguanylate cyclase  34.94 
 
 
504 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.466605 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0187  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.72 
 
 
469 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1694  diguanylate cyclase  32.18 
 
 
431 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3608  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.54 
 
 
430 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1230  diguanylate cyclase  35.12 
 
 
558 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.72 
 
 
792 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  35.64 
 
 
443 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1211  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.53 
 
 
587 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0242812 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1693  diguanylate cyclase  35.12 
 
 
564 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000442745  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1583  GGDEF domain-containing protein  41.18 
 
 
472 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.26 
 
 
860 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2732  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  35.12 
 
 
564 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000132125  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.26 
 
 
860 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5944  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.86 
 
 
745 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1905  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.88 
 
 
568 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00246734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00827  hypothetical protein  36.98 
 
 
626 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>