More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2577 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 372 aa  734    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  42.69 
 
 		 378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  43.3 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  38.65 
 
 		 295 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 368 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  34.97 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  31.37 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  35.04 
 
 		 356 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  33.09 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  28.96 
 
 		 324 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 240 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 151 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 76 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 192 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0664  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 881 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 881 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 876 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 189 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0591  hypothetical protein  33.58 
 
 		 252 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  26.22 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 894 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4067  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.352272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  34.44 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8455  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.32 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0699524  hitchhiker  0.00000314192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  56 
 
 		 217 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13650  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.55 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3378  LuxR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.394495  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 230 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.62 
 
 		 258 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0438  transcriptional regulatory protein UhpA  49.21 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  44.87 
 
 		 943 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 217 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  59.09 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.740026 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0269  transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 499 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  39.19 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 514 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 510 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 514 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 234 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 216 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 550 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 514 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 228 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 940 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 214 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  54.17 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  42.31 
 
 		 944 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  50.98 
 
 		 496 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6494  two component LuxR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 235 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0149487  normal  0.504125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 224 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 248 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 211 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  50.98 
 
 		 227 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 230 aa  53.5  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 213 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  39.76 
 
 		 224 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  39.76 
 
 		 224 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 223 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  50.91 
 
 		 963 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  53.1  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 211 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  49.09 
 
 		 913 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52 
 
 		 211 aa  53.1  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  38.46 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 879 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 201 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5114  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 230 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 913 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 232 aa  53.1  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 224 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 262 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>