More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0176 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4818  30S ribosomal protein S4  69.46 
 
 		 202 aa  278  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4369  30S ribosomal protein S4  66.83 
 
 		 202 aa  258  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  60.89 
 
 		 202 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  62.69 
 
 		 208 aa  247  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2011  30S ribosomal protein S4  62.19 
 
 		 208 aa  244  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658293  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  65.02 
 
 		 203 aa  244  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  63.68 
 
 		 208 aa  244  9e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17660  SSU ribosomal protein S4P  61.95 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.029171  normal  0.0852313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2281  30S ribosomal protein S4  64.18 
 
 		 208 aa  239  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6298  RNA-binding S4 domain-containing protein  61.62 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2018  30S ribosomal protein S4  62.19 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  60.2 
 
 		 208 aa  237  9e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0623  30S ribosomal protein S4  60.2 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115824  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  60.2 
 
 		 208 aa  235  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  59.7 
 
 		 208 aa  235  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16370  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  53.69 
 
 		 203 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  52.45 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  52.94 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  46.5 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  48.47 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  47.96 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  45.92 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  45.41 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  44.28 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  45.92 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  45.92 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  44.85 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 200 aa  157  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 200 aa  157  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  44 
 
 		 205 aa  157  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  42.78 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  46.02 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  43.08 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  48.37 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  44.9 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  43.37 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  43.3 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  41.24 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  41.33 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  43.65 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  47.47 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  41.84 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0324  30S ribosomal protein S4  45 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000000226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  46.02 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  46.46 
 
 		 205 aa  151  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2554  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  44.32 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  40.91 
 
 		 202 aa  150  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  45.03 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0830  30S ribosomal protein S4  46.46 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  46.02 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  43.07 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  46.97 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1947  30S ribosomal protein S4  46.97 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515321  normal  0.962011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1927  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  44.89 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  43.07 
 
 		 208 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  45.51 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 208 aa  147  9e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  42.86 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  41.92 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>