More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1971 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  55.56 
 
 		 645 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  68.68 
 
 		 767 aa  1104    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 		 771 aa  1589    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  59.28 
 
 		 642 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  68.45 
 
 		 767 aa  1104    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  55.25 
 
 		 644 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  49.28 
 
 		 772 aa  734    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  42.62 
 
 		 806 aa  624  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  41.87 
 
 		 794 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  50.17 
 
 		 702 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  39.21 
 
 		 736 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  47.43 
 
 		 785 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  41.76 
 
 		 738 aa  493  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  38.31 
 
 		 770 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  44.99 
 
 		 841 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  51.64 
 
 		 642 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  48.27 
 
 		 684 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  49.04 
 
 		 677 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  38.32 
 
 		 727 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  37.93 
 
 		 871 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  48.52 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.05 
 
 		 568 aa  364  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.67 
 
 		 571 aa  364  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.55 
 
 		 568 aa  364  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.17 
 
 		 568 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.89 
 
 		 553 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.08 
 
 		 555 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.59 
 
 		 568 aa  360  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.34 
 
 		 556 aa  360  6e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.57 
 
 		 568 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  37.8 
 
 		 558 aa  358  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.52 
 
 		 568 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.39 
 
 		 568 aa  357  5e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.22 
 
 		 568 aa  356  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.96 
 
 		 568 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  39.75 
 
 		 603 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  37.52 
 
 		 578 aa  356  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.71 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  39.7 
 
 		 577 aa  355  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.65 
 
 		 563 aa  352  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.93 
 
 		 599 aa  350  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.57 
 
 		 599 aa  350  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.57 
 
 		 599 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  38.14 
 
 		 553 aa  349  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  39.56 
 
 		 888 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  38.06 
 
 		 557 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.67 
 
 		 571 aa  346  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.2 
 
 		 573 aa  346  8.999999999999999e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.69 
 
 		 562 aa  346  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  35.03 
 
 		 572 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.67 
 
 		 566 aa  344  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.14 
 
 		 566 aa  344  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1620  type II secretion system protein E  41.01 
 
 		 616 aa  344  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.3 
 
 		 568 aa  343  9e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  36.5 
 
 		 559 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37 
 
 		 557 aa  342  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.22 
 
 		 549 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.59 
 
 		 569 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  34.59 
 
 		 569 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.49 
 
 		 572 aa  339  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  37.39 
 
 		 885 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.22 
 
 		 563 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.42 
 
 		 577 aa  337  5e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  38.28 
 
 		 561 aa  335  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  36.56 
 
 		 563 aa  335  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  36.46 
 
 		 541 aa  335  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.27 
 
 		 559 aa  334  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  44.78 
 
 		 544 aa  334  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  45.43 
 
 		 560 aa  334  4e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.65 
 
 		 577 aa  333  9e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  43.53 
 
 		 561 aa  333  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  42.82 
 
 		 585 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  37.36 
 
 		 562 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  35.54 
 
 		 570 aa  332  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.3 
 
 		 565 aa  331  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  44.58 
 
 		 577 aa  331  3e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  38.36 
 
 		 561 aa  331  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  37.83 
 
 		 520 aa  331  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  41.78 
 
 		 567 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  36.81 
 
 		 610 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.53 
 
 		 571 aa  330  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  34.9 
 
 		 591 aa  330  6e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  35.54 
 
 		 558 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.39 
 
 		 577 aa  329  9e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0863  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  41.25 
 
 		 573 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  37.64 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  42.27 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  37.06 
 
 		 563 aa  328  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  37.09 
 
 		 891 aa  328  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.11 
 
 		 572 aa  328  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  39.23 
 
 		 574 aa  327  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.7 
 
 		 569 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  39.31 
 
 		 580 aa  327  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  37.06 
 
 		 553 aa  327  6e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  39.46 
 
 		 574 aa  327  7e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  35.68 
 
 		 787 aa  326  8.000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  39.36 
 
 		 561 aa  326  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  34.04 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  37.66 
 
 		 573 aa  326  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.03 
 
 		 569 aa  324  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>