174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4320 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  60.71 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  60.27 
 
 		 225 aa  278  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  57.47 
 
 		 219 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  41.36 
 
 		 546 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  35.5 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  34.53 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  32.31 
 
 		 280 aa  98.6  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  29.13 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  32.16 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  30.63 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  28.05 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  32.55 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.05 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.3 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.22 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  27.52 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.11 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  28.51 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  23.41 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  26.67 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.98 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  31.02 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  25.58 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.36 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  24.15 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  27 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  25 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  28.57 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  29.06 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  26.91 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  26.91 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  27.7 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.11 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  27.4 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  24.61 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  27.4 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  26.46 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  27.4 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.19 
 
 		 165 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  30.51 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  26.11 
 
 		 170 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.57 
 
 		 170 aa  62  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.31 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.75 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  26.67 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  24.77 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  27.75 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.87 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.04 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  30 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  26.42 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  22.17 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  22.69 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  26.41 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  21.18 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  26.83 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.07 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  25.35 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.6 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.4 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  21.54 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  26.09 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  24.53 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  37.04 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  28.05 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  28.06 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  26.69 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  36.05 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  27.36 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  26.25 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  26.26 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  22.43 
 
 		 166 aa  52.4  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  22.27 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  22.07 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  23.39 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  34.88 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.74 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  29.52 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  25.23 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  24.57 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  20.74 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  24.76 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  31.94 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  24.52 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.62 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  33.9 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.88 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  20.09 
 
 		 180 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  27.4 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  28.5 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  37.93 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  19.31 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.85 
 
 		 584 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  23.96 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  28.34 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  36.76 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  25.49 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  22.58 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  19.91 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>