183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1688 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
230 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  51.57 
 
 
228 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  53.02 
 
 
228 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  51.68 
 
 
235 aa  208  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  50.66 
 
 
230 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  50.66 
 
 
230 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  50.66 
 
 
230 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.02 
 
 
230 aa  191  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  45.58 
 
 
203 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.77 
 
 
232 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  40.93 
 
 
228 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  38.86 
 
 
253 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  38.12 
 
 
209 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1991  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.24 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.13 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  33.33 
 
 
234 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  35.48 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  28.63 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.13 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  28.86 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.1 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  29.76 
 
 
222 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32.26 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  30.09 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.93 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  31.53 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.09 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.84 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0025  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.5 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.61 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  34.51 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  29 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  32.37 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  34.29 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  30.09 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  25.65 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.15 
 
 
224 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.09 
 
 
197 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.31 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.59 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  40 
 
 
583 aa  55.5  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.67 
 
 
234 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  31.52 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  36.25 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  23.56 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  23.56 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  24.06 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  35.83 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  23.53 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1857  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.07 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1831  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.07 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  37.04 
 
 
249 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  32.63 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.7 
 
 
233 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.37 
 
 
254 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.7 
 
 
233 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  37.86 
 
 
257 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  32.95 
 
 
233 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.53 
 
 
224 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  43.75 
 
 
220 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  22.6 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.62 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.21 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.76 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.29 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0456  phosphoglycolate phosphatase  37.08 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.71 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  22.87 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  23.53 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.46 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  30.1 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2083  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.27 
 
 
178 aa  49.3  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.946947  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  34.68 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.64 
 
 
206 aa  48.5  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  31.53 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  23.68 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.17 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  39.08 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.29 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.03 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07140  predicted phosphatase  30.36 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.580043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.7 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  35.92 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  22.22 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.25 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.59 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.11 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  42.62 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.33 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  37.93 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.46 
 
 
1125 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.64 
 
 
268 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>