More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0240 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
268 aa  524  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  70.97 
 
 
253 aa  355  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  65.16 
 
 
251 aa  300  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  65.57 
 
 
244 aa  296  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  61.73 
 
 
263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.73 
 
 
263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.74 
 
 
254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.32 
 
 
263 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  65.98 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.87 
 
 
244 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  55.87 
 
 
262 aa  262  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.61 
 
 
236 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.38 
 
 
243 aa  250  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.06 
 
 
243 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.4 
 
 
252 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.6 
 
 
249 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  57.38 
 
 
238 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.7 
 
 
250 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  54.39 
 
 
1088 aa  235  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  50.63 
 
 
1314 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.03 
 
 
246 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  47.88 
 
 
1053 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  48.09 
 
 
1055 aa  224  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.7 
 
 
252 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.59 
 
 
525 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  48.18 
 
 
260 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.66 
 
 
240 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.38 
 
 
1051 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.23 
 
 
1053 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.61 
 
 
1051 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.96 
 
 
1052 aa  214  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.88 
 
 
1050 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.17 
 
 
262 aa  208  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.15 
 
 
246 aa  194  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.67 
 
 
252 aa  194  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.86 
 
 
313 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.36 
 
 
257 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.19 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.73 
 
 
1053 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.56 
 
 
248 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.23 
 
 
250 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.91 
 
 
1125 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.43 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  35.27 
 
 
1327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  35.14 
 
 
219 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.69 
 
 
214 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
216 aa  98.6  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  33.88 
 
 
218 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.93 
 
 
216 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  34.84 
 
 
246 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  30.84 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.39 
 
 
242 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  31.22 
 
 
207 aa  86.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.58 
 
 
245 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.9 
 
 
215 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.84 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.79 
 
 
248 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  33.2 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  32.93 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.52 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.99 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  28.21 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  29.47 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  31.9 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  31.12 
 
 
965 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  30.96 
 
 
978 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.71 
 
 
233 aa  72  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  32.35 
 
 
218 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  29.05 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  32.35 
 
 
218 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.67 
 
 
232 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  32.35 
 
 
218 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  28.99 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  24.47 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  30.99 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  26.58 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.8 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  28.84 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18961  phosphatase/phosphohexomutase  32.27 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.28 
 
 
456 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  37.19 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.7 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  32.23 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  30.51 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  27.14 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.28 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  51.39 
 
 
346 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.19 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  27.18 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.22 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.7 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.46 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  25.23 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  26.67 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  30.29 
 
 
986 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  26.67 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.56 
 
 
202 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  28.74 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>