More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6157 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
245 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  79.31 
 
 
242 aa  363  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  77.35 
 
 
246 aa  348  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.62 
 
 
248 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  58.41 
 
 
242 aa  225  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.41 
 
 
242 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  56.16 
 
 
248 aa  221  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.6 
 
 
248 aa  197  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.45 
 
 
268 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.48 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.24 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.27 
 
 
236 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  35.27 
 
 
216 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.07 
 
 
249 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.47 
 
 
243 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.17 
 
 
254 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.74 
 
 
262 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.8 
 
 
1314 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.71 
 
 
243 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.03 
 
 
250 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.67 
 
 
214 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.35 
 
 
456 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.91 
 
 
258 aa  99  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.1 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.87 
 
 
525 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.35 
 
 
456 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.58 
 
 
1055 aa  97.4  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.79 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
456 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.12 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.12 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.12 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.27 
 
 
246 aa  95.5  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.27 
 
 
253 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.68 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.8 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.77 
 
 
1052 aa  92  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  35.09 
 
 
242 aa  92  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.85 
 
 
251 aa  91.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  91.7  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.03 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.54 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.33 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.68 
 
 
1051 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.64 
 
 
1051 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.27 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  34.55 
 
 
219 aa  89  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  34 
 
 
219 aa  88.6  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 
215 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  32.99 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.24 
 
 
1053 aa  86.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  33.2 
 
 
262 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.07 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.25 
 
 
1125 aa  85.5  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.43 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.13 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.4 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.22 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.66 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.35 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1156  HAD family hydrolase  29.09 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0666674  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.34 
 
 
1053 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  30.17 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  25.54 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.74 
 
 
1050 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.06 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  32.51 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  27.68 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  28.43 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  24.66 
 
 
220 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.9 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.78 
 
 
1053 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  28.11 
 
 
396 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  31.63 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  28.88 
 
 
728 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  34.21 
 
 
707 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  28.43 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  30.83 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  33.55 
 
 
710 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.92 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.57 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  25.23 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.58 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  32.19 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  27.11 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.09 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  25.79 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  36.52 
 
 
216 aa  72  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  33.55 
 
 
707 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.18 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  30.58 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.9 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.19 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.79 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>