More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0532 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 248 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  81.89 
 
 		 248 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  80.82 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  73.82 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  73.71 
 
 		 242 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.72 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  58.45 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.6 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.03 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.04 
 
 		 223 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  37.89 
 
 		 219 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.66 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.66 
 
 		 1053 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.71 
 
 		 1314 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.61 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  33.2 
 
 		 456 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.92 
 
 		 456 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  33.2 
 
 		 456 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.73 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1156  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0666674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.23 
 
 		 214 aa  98.6  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.49 
 
 		 1051 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.01 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.57 
 
 		 1051 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  36.56 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.65 
 
 		 207 aa  95.5  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.73 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.03 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  32.31 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 396 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.17 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.6 
 
 		 313 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32 
 
 		 1050 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.58 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 		 215 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.73 
 
 		 525 aa  92.4  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.06 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.59 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.29 
 
 		 1053 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.13 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.63 
 
 		 1052 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.58 
 
 		 1053 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.83 
 
 		 1055 aa  89.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.33 
 
 		 1088 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.93 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.24 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  31.88 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  32.05 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.17 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.22 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.85 
 
 		 1125 aa  85.9  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.67 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  34.44 
 
 		 986 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.67 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  33.62 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.67 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.48 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  32.89 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.67 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  33.94 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  28.35 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.68 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.18 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  34.01 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  31.78 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  35.68 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  35.68 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  35.68 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  35.68 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  34.65 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  33.33 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.08 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  31.22 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.48 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0787  HAD family sugar phosphatase  31.28 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  34.53 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  35.18 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  33.84 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  35.18 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  33.84 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.47 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  33.84 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  24.79 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  29.95 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  33.84 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  31.22 
 
 		 585 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  29.73 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  28.9 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  27.48 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.93 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.08 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.96 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>