More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1494 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
240 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.6 
 
 
249 aa  254  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60 
 
 
238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.87 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.87 
 
 
251 aa  231  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.94 
 
 
243 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  56.49 
 
 
236 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  53.25 
 
 
263 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.25 
 
 
263 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.85 
 
 
263 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.66 
 
 
268 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.17 
 
 
244 aa  214  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  52.42 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.44 
 
 
243 aa  209  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.98 
 
 
254 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.39 
 
 
252 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.15 
 
 
1314 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.01 
 
 
253 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.72 
 
 
262 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.15 
 
 
525 aa  191  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.53 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.86 
 
 
246 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.34 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.31 
 
 
246 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.39 
 
 
248 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.87 
 
 
250 aa  178  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.7 
 
 
252 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.53 
 
 
250 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  41 
 
 
1055 aa  175  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.41 
 
 
252 aa  175  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.86 
 
 
1088 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.19 
 
 
1051 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.93 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.95 
 
 
1051 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.95 
 
 
1053 aa  170  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  43.09 
 
 
260 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.43 
 
 
1052 aa  168  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.15 
 
 
313 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  42.37 
 
 
1053 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.22 
 
 
1050 aa  164  9e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.65 
 
 
1125 aa  145  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.74 
 
 
1053 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.64 
 
 
223 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.2 
 
 
268 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
219 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.25 
 
 
248 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  35.42 
 
 
248 aa  99  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.58 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  33.33 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  35.08 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  34.3 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  34.48 
 
 
246 aa  92  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  30.65 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  30.77 
 
 
1327 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  34.6 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.18 
 
 
242 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
245 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  32.82 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  31.5 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.21 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.32 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  30.46 
 
 
216 aa  79  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.17 
 
 
248 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  31.2 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  30 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  27.39 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  32.75 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  30.25 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  31.58 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  28.77 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  30.48 
 
 
965 aa  72.8  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.29 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  30.77 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09091  putative CbbY-like protein  23.04 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.642347  hitchhiker  0.000010947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  32.33 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  30.66 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  26.75 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  28.63 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  28.63 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  28.63 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
978 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  29.9 
 
 
585 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  29.1 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  27.72 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  28.09 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  28.06 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.5 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  28.09 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  25.26 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1242  HAD family hydrolase  29.11 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.02 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  29.1 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.34 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  27.16 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.72 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  29.11 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>