More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0437 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
244 aa  482  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  90.57 
 
 
251 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  64.56 
 
 
244 aa  290  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  63.29 
 
 
253 aa  286  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.51 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.87 
 
 
268 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  60.5 
 
 
263 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.5 
 
 
263 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.45 
 
 
238 aa  275  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  68.49 
 
 
243 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.08 
 
 
263 aa  274  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  57.14 
 
 
262 aa  254  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.82 
 
 
236 aa  251  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  63.64 
 
 
252 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.7 
 
 
248 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.13 
 
 
249 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  56.67 
 
 
243 aa  245  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  50.85 
 
 
1314 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.67 
 
 
1088 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.12 
 
 
525 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.43 
 
 
250 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.41 
 
 
1051 aa  224  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  47.84 
 
 
1053 aa  221  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.55 
 
 
1052 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.26 
 
 
1055 aa  217  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.55 
 
 
1053 aa  217  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.92 
 
 
1051 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.17 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.85 
 
 
262 aa  208  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  48.73 
 
 
260 aa  205  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.63 
 
 
246 aa  206  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.76 
 
 
1050 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.72 
 
 
313 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.42 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.88 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.21 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.5 
 
 
248 aa  194  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.88 
 
 
257 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.74 
 
 
252 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.31 
 
 
250 aa  181  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.48 
 
 
1053 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.03 
 
 
1125 aa  152  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  36.77 
 
 
1327 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.98 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  34.89 
 
 
218 aa  92.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30 
 
 
219 aa  91.7  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  32.35 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.12 
 
 
242 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.73 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.15 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.27 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  25.64 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  29.44 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  27.31 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  28.94 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.61 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  27.43 
 
 
456 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.9 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  28.27 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.32 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.22 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  27.5 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  28.51 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  23.83 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
225 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.83 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.5 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  24.39 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  29.66 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.12 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.31 
 
 
978 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  24.69 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  26.23 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  24.31 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  30.21 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  29.91 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.42 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  30.41 
 
 
965 aa  66.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  28.5 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.54 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  28.76 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  30.21 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.79 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  29.33 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  29.44 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.55 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  28.29 
 
 
215 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  29.33 
 
 
202 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.52 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.76 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.86 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  24.28 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.68 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.81 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>