More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4370 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.83 
 
 
1050 aa  839    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.1 
 
 
1053 aa  877    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  48.94 
 
 
1327 aa  744    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.58 
 
 
1052 aa  855    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.16 
 
 
1125 aa  857    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3044  trehalose 6-phosphate phosphorylase  52.16 
 
 
804 aa  788    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.886681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  48.88 
 
 
807 aa  732    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  53.9 
 
 
1314 aa  946    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  43.28 
 
 
1053 aa  847    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  41.92 
 
 
1055 aa  860    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  100 
 
 
1088 aa  2240    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  51.68 
 
 
1215 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  49.44 
 
 
788 aa  768    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.01 
 
 
1053 aa  838    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.48 
 
 
1051 aa  863    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  51.68 
 
 
1215 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  49.41 
 
 
1225 aa  794    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4811  trehalose 6-phosphate phosphorylase  49.72 
 
 
713 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  56.86 
 
 
807 aa  926    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  50.76 
 
 
807 aa  808    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.42 
 
 
1051 aa  823    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  51.68 
 
 
1215 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  53.09 
 
 
794 aa  816    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  50.25 
 
 
1186 aa  761    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  37.85 
 
 
904 aa  522  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1283  glycoside hydrolase family protein 65  35.62 
 
 
806 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.461041 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  32.63 
 
 
769 aa  402  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  31.42 
 
 
755 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  28.47 
 
 
780 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  32.43 
 
 
748 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  29.7 
 
 
775 aa  335  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  31.4 
 
 
978 aa  334  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  31.66 
 
 
787 aa  333  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  30.33 
 
 
759 aa  332  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  28.73 
 
 
763 aa  328  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  30.21 
 
 
965 aa  318  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  31.21 
 
 
781 aa  308  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  30.4 
 
 
807 aa  308  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  29.41 
 
 
789 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  30.14 
 
 
787 aa  301  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  29.65 
 
 
794 aa  291  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  30.64 
 
 
720 aa  283  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.22 
 
 
759 aa  279  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  27.15 
 
 
778 aa  278  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  28.68 
 
 
757 aa  271  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  26.64 
 
 
781 aa  270  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  26.55 
 
 
780 aa  269  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  27.21 
 
 
769 aa  264  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  28.48 
 
 
790 aa  261  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  28.05 
 
 
790 aa  259  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  29.61 
 
 
760 aa  258  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  55.65 
 
 
253 aa  252  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  28.34 
 
 
795 aa  250  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  27.95 
 
 
795 aa  249  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.26 
 
 
525 aa  248  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  30.54 
 
 
776 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  27.61 
 
 
795 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  25.77 
 
 
774 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.95 
 
 
762 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.75 
 
 
263 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  53.33 
 
 
263 aa  244  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.33 
 
 
263 aa  244  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.72 
 
 
254 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  28.94 
 
 
761 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  28.68 
 
 
761 aa  241  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  26.5 
 
 
755 aa  235  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  26.5 
 
 
755 aa  235  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.39 
 
 
268 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  26.5 
 
 
755 aa  235  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.44 
 
 
825 aa  233  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  26.38 
 
 
755 aa  232  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  26.73 
 
 
755 aa  232  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  26.38 
 
 
755 aa  232  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  26.38 
 
 
755 aa  230  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3525  trehalose 6-phosphate phosphorylase  37.98 
 
 
450 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125105  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.02 
 
 
251 aa  229  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.67 
 
 
244 aa  229  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.88 
 
 
244 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  27.12 
 
 
755 aa  228  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.74 
 
 
749 aa  228  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.27 
 
 
260 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  26 
 
 
858 aa  227  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.97 
 
 
252 aa  227  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  26.34 
 
 
771 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  32.72 
 
 
777 aa  226  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  24.44 
 
 
780 aa  220  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.95 
 
 
250 aa  219  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  26.56 
 
 
753 aa  217  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  25.45 
 
 
789 aa  214  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  47.52 
 
 
262 aa  213  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1019  Kojibiose phosphorylase  25.06 
 
 
756 aa  212  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  24.21 
 
 
788 aa  212  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  28.17 
 
 
704 aa  212  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.33 
 
 
248 aa  211  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  26.9 
 
 
800 aa  211  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  24.66 
 
 
805 aa  210  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.21 
 
 
238 aa  207  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.85 
 
 
246 aa  206  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  24.67 
 
 
843 aa  206  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.23 
 
 
313 aa  204  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>