More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
248 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.07 
 
 
246 aa  268  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  63.71 
 
 
262 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  59.68 
 
 
252 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.72 
 
 
246 aa  248  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.13 
 
 
258 aa  232  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  56.41 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  56.84 
 
 
250 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.16 
 
 
238 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.65 
 
 
249 aa  221  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.32 
 
 
244 aa  214  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.05 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50 
 
 
313 aa  211  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.85 
 
 
263 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.85 
 
 
263 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.59 
 
 
1314 aa  208  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.44 
 
 
263 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.26 
 
 
251 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.5 
 
 
244 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  49.79 
 
 
253 aa  197  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  48.37 
 
 
262 aa  197  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.39 
 
 
525 aa  195  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.3 
 
 
1053 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.72 
 
 
1055 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.94 
 
 
243 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  47.37 
 
 
1088 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.57 
 
 
1053 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.11 
 
 
1051 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.68 
 
 
1052 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.47 
 
 
1053 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.56 
 
 
268 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.77 
 
 
243 aa  185  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.44 
 
 
250 aa  184  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.57 
 
 
1051 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.93 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.35 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.79 
 
 
248 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.21 
 
 
252 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.32 
 
 
252 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.26 
 
 
1050 aa  175  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.27 
 
 
1125 aa  169  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.89 
 
 
260 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.05 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  37.1 
 
 
1327 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.92 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  38.43 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  38.28 
 
 
218 aa  101  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.93 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.68 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  34.1 
 
 
221 aa  95.1  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  32.88 
 
 
216 aa  92.4  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.97 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  30.77 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  31.09 
 
 
219 aa  89.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  32.77 
 
 
215 aa  89.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  32.78 
 
 
248 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.02 
 
 
248 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.67 
 
 
207 aa  85.9  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  32.05 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  34.01 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  32.68 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.81 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  30.51 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  29.65 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.64 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  31.12 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.36 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
978 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.3 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  30.8 
 
 
218 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  34.57 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  31.58 
 
 
965 aa  76.3  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.2 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  32.55 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.3 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.66 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  32.84 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.67 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  32.14 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.8 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.47 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  30.38 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.91 
 
 
456 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.97 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  28.71 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  31.65 
 
 
221 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  27.96 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  32.2 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  32.07 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  32.82 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.43 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  29.65 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  28.35 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  35.05 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.86 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.13 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  27.8 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  30.34 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.22 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  30.05 
 
 
585 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>