More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
246 aa  481  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.18 
 
 
252 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.72 
 
 
257 aa  254  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.34 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  56.84 
 
 
258 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.97 
 
 
250 aa  241  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.32 
 
 
246 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.72 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.03 
 
 
268 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.04 
 
 
244 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  52.32 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.32 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.9 
 
 
263 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  47.56 
 
 
1314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  50 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.79 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.81 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.33 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.8 
 
 
1053 aa  211  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.55 
 
 
1053 aa  209  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.44 
 
 
250 aa  209  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.45 
 
 
525 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.69 
 
 
1052 aa  207  8e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.34 
 
 
1051 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  47.27 
 
 
262 aa  206  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.05 
 
 
238 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  50.85 
 
 
1088 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.63 
 
 
244 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  44.87 
 
 
1055 aa  205  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.69 
 
 
1051 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.96 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.84 
 
 
248 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  47.7 
 
 
260 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.61 
 
 
1050 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.39 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.56 
 
 
243 aa  195  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.58 
 
 
236 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.56 
 
 
1125 aa  191  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.08 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.02 
 
 
313 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.31 
 
 
240 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.22 
 
 
1053 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.14 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  36.94 
 
 
1327 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  34.89 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  37.91 
 
 
218 aa  98.6  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.14 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.29 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  34.12 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
248 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.27 
 
 
245 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.86 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
220 aa  85.5  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  29.25 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.58 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.3 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  30.29 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  29.86 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.17 
 
 
207 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.66 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  30.8 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.83 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  29.67 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.39 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.79 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  32.6 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  30.2 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.69 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.86 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  27.96 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  29.07 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.93 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.43 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.77 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.82 
 
 
456 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  33.19 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.95 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.7 
 
 
220 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  31.91 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.2 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  29.44 
 
 
965 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  32.91 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  34.2 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  27.47 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  27.47 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.31 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.43 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  28.44 
 
 
456 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  31.51 
 
 
218 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
217 aa  72  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
202 aa  72  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  31.76 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  26.41 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  31.09 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  31.65 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  31.65 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  27.85 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  31.65 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>