222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2155 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  100 
 
 		 346 aa  694    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.4 
 
 		 525 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.43 
 
 		 1314 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  53.56 
 
 		 271 aa  281  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  44.17 
 
 		 417 aa  262  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  42.6 
 
 		 1215 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  42.6 
 
 		 1215 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  42.6 
 
 		 1215 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  43.75 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  40.3 
 
 		 1186 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  39.88 
 
 		 1225 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  48.99 
 
 		 265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  39.23 
 
 		 1327 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43599  predicted protein  39.31 
 
 		 302 aa  179  8e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal  0.825443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2549  HAD family hydrolase  41.87 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  33.2 
 
 		 294 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  35.22 
 
 		 268 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3062  trehalose-phosphatase  33.57 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2827  HAD family hydrolase  33.93 
 
 		 253 aa  95.9  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0316948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0840  trehalose-phosphatase  31.58 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  34.15 
 
 		 229 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  33.47 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 261 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  34.14 
 
 		 258 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  31.85 
 
 		 269 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  31.33 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  35.1 
 
 		 238 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  33.2 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  35.55 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  30.99 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  31.43 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  33.2 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3128  trehalose-phosphatase  30.83 
 
 		 264 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  31.33 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  30.87 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  32.78 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3270  trehalose-phosphatase  30.04 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  31.33 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  31.33 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  28.45 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  31.33 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  31.33 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  35.12 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2971  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  31.8 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  30.9 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  30.9 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.63 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0296  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.26 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  33.81 
 
 		 847 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5832  trehalose-phosphatase  33.33 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  35.8 
 
 		 867 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  32.64 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0919  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.26 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0356723  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  30.04 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  30.65 
 
 		 265 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.63 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  29.56 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.56 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0799  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  26.91 
 
 		 733 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.33 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4792  trehalose-phosphatase  25.67 
 
 		 738 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.8 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.71 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1092  trehalose-phosphatase  33.66 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.693054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  30.84 
 
 		 744 aa  72.8  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  35.39 
 
 		 867 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4269  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.582596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.83 
 
 		 257 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1722  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  27.64 
 
 		 268 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.2 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  28.4 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2216  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  28.29 
 
 		 752 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2336  trehalose-phosphatase  27.71 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.922913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0483  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  31.27 
 
 		 723 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.967333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  26.39 
 
 		 731 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  32.45 
 
 		 867 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.33 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.51 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0478  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  31.64 
 
 		 723 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0393601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2061  trehalose-phosphatase  32.13 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.52 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  28.94 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  26.67 
 
 		 745 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  30.23 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  28.94 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  53.85 
 
 		 1088 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4022  trehalose-phosphatase  27.3 
 
 		 724 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179404  normal  0.381996 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79118  threalose-6-phosphate phosphatase  27.11 
 
 		 877 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  56.67 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5011  trehalose-phosphatase  34.88 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>