More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1537 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  100 
 
 		 604 aa  1160    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  53.38 
 
 		 605 aa  539  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  45.87 
 
 		 600 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  45.18 
 
 		 612 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0219  Citrate transporter  51.76 
 
 		 600 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000273503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  34.49 
 
 		 612 aa  319  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.42 
 
 		 609 aa  307  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  34.71 
 
 		 613 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.62 
 
 		 630 aa  280  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.62 
 
 		 610 aa  280  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  32.58 
 
 		 609 aa  279  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.45 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.45 
 
 		 588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.95 
 
 		 609 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  32.7 
 
 		 609 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  32.45 
 
 		 610 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  48.97 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.41 
 
 		 619 aa  264  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  31.32 
 
 		 620 aa  263  6e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.36 
 
 		 611 aa  263  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  32.45 
 
 		 610 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  32.07 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  32.53 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  30.25 
 
 		 610 aa  261  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  29.61 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  30.16 
 
 		 616 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  30.96 
 
 		 621 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  29.65 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  29.61 
 
 		 610 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  29.77 
 
 		 611 aa  250  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.76 
 
 		 593 aa  250  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  29.61 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  29.61 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  29.61 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  29.61 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  29.61 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  29.61 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  32.44 
 
 		 627 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  29.62 
 
 		 619 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  29.44 
 
 		 610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 		 605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  28.03 
 
 		 608 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  27.86 
 
 		 608 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  27.86 
 
 		 608 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  27.69 
 
 		 608 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  27.69 
 
 		 608 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  27.8 
 
 		 610 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.95 
 
 		 588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  30.84 
 
 		 609 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  31.07 
 
 		 606 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  33.64 
 
 		 545 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  28.78 
 
 		 588 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.24 
 
 		 616 aa  216  8e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.58 
 
 		 632 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  28.38 
 
 		 604 aa  211  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  28.24 
 
 		 593 aa  211  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 		 591 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.5 
 
 		 608 aa  210  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  29.45 
 
 		 592 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  26.3 
 
 		 602 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.94 
 
 		 594 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  27.55 
 
 		 597 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  27.68 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  26.49 
 
 		 609 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 605 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  25.96 
 
 		 596 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 		 593 aa  203  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  31.13 
 
 		 587 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  29.61 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.62 
 
 		 588 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  30.81 
 
 		 591 aa  200  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  26.96 
 
 		 620 aa  199  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  28.34 
 
 		 588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.08 
 
 		 593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.73 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  29.89 
 
 		 586 aa  197  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.84 
 
 		 614 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  29.55 
 
 		 596 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  27.57 
 
 		 622 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  28.03 
 
 		 613 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  27.84 
 
 		 592 aa  193  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  28.57 
 
 		 590 aa  193  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  26.62 
 
 		 607 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.01 
 
 		 581 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  31.27 
 
 		 593 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29 
 
 		 627 aa  191  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  27.35 
 
 		 592 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  27.35 
 
 		 592 aa  190  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30.95 
 
 		 618 aa  190  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  28.17 
 
 		 641 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  25.62 
 
 		 590 aa  189  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  25.21 
 
 		 590 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  27.44 
 
 		 588 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  26.17 
 
 		 591 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  31 
 
 		 591 aa  187  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  30.22 
 
 		 623 aa  186  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  30.93 
 
 		 592 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  29.53 
 
 		 620 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  27.5 
 
 		 650 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  29.32 
 
 		 599 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>