More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0231 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 342 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.56 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  27.15 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 288 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  25.5 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 314 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  26.33 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 314 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  26.17 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 791 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 791 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 844 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  24.27 
 
 		 313 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 791 aa  87  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 332 aa  86.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  24.16 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  24.46 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  23.46 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  24.52 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.37 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  24.66 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  23.62 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 255 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0675  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.18 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>