108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2888 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  41.4 
 
 		 1106 aa  806    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 1294 aa  2627    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  41.13 
 
 		 1110 aa  814    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  51.85 
 
 		 1017 aa  348  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  49.88 
 
 		 902 aa  345  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  47.48 
 
 		 1018 aa  335  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  49.15 
 
 		 1009 aa  333  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  47.12 
 
 		 1017 aa  330  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  47.56 
 
 		 1038 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  43.32 
 
 		 1036 aa  268  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  41.59 
 
 		 957 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  41.81 
 
 		 1046 aa  259  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  40.24 
 
 		 955 aa  255  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  42.07 
 
 		 958 aa  253  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  42.07 
 
 		 958 aa  252  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  42.22 
 
 		 1053 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  34.55 
 
 		 554 aa  214  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  43.42 
 
 		 1143 aa  200  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  43.93 
 
 		 1143 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  31.69 
 
 		 534 aa  188  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  31.42 
 
 		 593 aa  180  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  32.7 
 
 		 611 aa  179  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  28.1 
 
 		 595 aa  173  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  30.63 
 
 		 812 aa  173  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  29.84 
 
 		 490 aa  151  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  30.06 
 
 		 500 aa  141  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  26.84 
 
 		 768 aa  140  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1601 aa  140  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.14 
 
 		 744 aa  135  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1100  cytochrome C family protein  51.8 
 
 		 321 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.103207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1099  hypothetical protein  52.48 
 
 		 324 aa  128  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  25.48 
 
 		 783 aa  116  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  28.72 
 
 		 789 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1151  hypothetical protein  45.14 
 
 		 230 aa  101  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  31.36 
 
 		 946 aa  95.5  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  41.73 
 
 		 1281 aa  82  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  24.43 
 
 		 867 aa  67.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  27.79 
 
 		 2499 aa  67  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1829  hypothetical protein  27.15 
 
 		 570 aa  62  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  25.86 
 
 		 1196 aa  60.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  27.52 
 
 		 317 aa  57.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  23.51 
 
 		 916 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1537 aa  57  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1538 aa  55.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  26 
 
 		 2912 aa  54.3  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  24.66 
 
 		 318 aa  54.3  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  26.06 
 
 		 329 aa  54.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  25.68 
 
 		 979 aa  54.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  28.89 
 
 		 326 aa  53.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  26.49 
 
 		 1611 aa  53.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  25 
 
 		 317 aa  53.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  26.01 
 
 		 333 aa  53.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  24.81 
 
 		 656 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  23.69 
 
 		 312 aa  52.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  26.32 
 
 		 1276 aa  52.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  24.94 
 
 		 650 aa  52  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  26.62 
 
 		 314 aa  52  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  25.15 
 
 		 427 aa  52  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  26.67 
 
 		 326 aa  51.6  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  26.56 
 
 		 346 aa  51.6  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3839  cytochrome C family protein  28.33 
 
 		 330 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  25.53 
 
 		 328 aa  51.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  25.63 
 
 		 346 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  25.64 
 
 		 307 aa  50.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  25 
 
 		 333 aa  50.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  23.32 
 
 		 315 aa  50.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  25.63 
 
 		 346 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  25.63 
 
 		 346 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  26.05 
 
 		 1521 aa  49.7  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  24.6 
 
 		 317 aa  50.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  25 
 
 		 577 aa  48.9  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  25 
 
 		 340 aa  48.9  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  25.74 
 
 		 901 aa  48.5  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 259 aa  48.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  21.88 
 
 		 646 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  26.21 
 
 		 2803 aa  48.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  23.79 
 
 		 318 aa  48.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  27.02 
 
 		 333 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  25.36 
 
 		 316 aa  48.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  24.86 
 
 		 1454 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  25.83 
 
 		 442 aa  48.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  26.91 
 
 		 329 aa  47  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  30.34 
 
 		 1691 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  27.02 
 
 		 333 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  24.62 
 
 		 319 aa  47.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  27.02 
 
 		 333 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  25.58 
 
 		 540 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  27.02 
 
 		 333 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  22.4 
 
 		 1596 aa  46.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  31.41 
 
 		 331 aa  47  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  25.12 
 
 		 304 aa  47  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  26.43 
 
 		 316 aa  46.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  22.91 
 
 		 2081 aa  46.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  23.69 
 
 		 1453 aa  45.8  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  24.37 
 
 		 330 aa  45.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  23.53 
 
 		 449 aa  45.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  26.64 
 
 		 299 aa  45.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1857  fibronectin type III domain-containing protein  23.75 
 
 		 733 aa  45.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  26.67 
 
 		 329 aa  45.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  24.91 
 
 		 321 aa  45.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>