More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3273 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  64.09 
 
 		 513 aa  692    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  64.09 
 
 		 513 aa  687    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  63.69 
 
 		 513 aa  685    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  64.29 
 
 		 513 aa  690    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  63.58 
 
 		 513 aa  686    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  64.09 
 
 		 513 aa  687    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  60.26 
 
 		 627 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 549 aa  1134    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  63.89 
 
 		 513 aa  687    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  63.77 
 
 		 507 aa  628  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  63.39 
 
 		 507 aa  623  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  51.77 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  50.83 
 
 		 481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  49.9 
 
 		 480 aa  512  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  49.17 
 
 		 488 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  49.06 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  48.38 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  48.97 
 
 		 488 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  49.48 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  46.84 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  46.28 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  43.99 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  43.99 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  43.99 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  43.99 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  43.79 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  44.08 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  42.86 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  42.86 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  42.86 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  42.86 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  42.65 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  42.65 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  44.42 
 
 		 496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  42.2 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  41.38 
 
 		 576 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  40.9 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  40.47 
 
 		 623 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  31.71 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  30.93 
 
 		 469 aa  163  8.000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  28.95 
 
 		 479 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  28.89 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  39.62 
 
 		 456 aa  87.4  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  26.38 
 
 		 979 aa  80.9  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  23.91 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  23.8 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 		 662 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.08 
 
 		 1942 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  23.97 
 
 		 617 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  22.36 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.72 
 
 		 1855 aa  70.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  32.29 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  25.58 
 
 		 1017 aa  70.1  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  24.53 
 
 		 599 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  23.54 
 
 		 617 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  24.22 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 		 838 aa  67.8  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  24.04 
 
 		 586 aa  67  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  22.75 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  24.61 
 
 		 836 aa  66.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.22 
 
 		 1975 aa  66.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  23.16 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  22.11 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  23.48 
 
 		 624 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.98 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  23.98 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.98 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.98 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  22.4 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.09 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  23.18 
 
 		 583 aa  63.9  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  22.79 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.71 
 
 		 586 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.22 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.93 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  24.32 
 
 		 620 aa  62.8  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.22 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.43 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  23.91 
 
 		 554 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  23.06 
 
 		 574 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.43 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  22.65 
 
 		 642 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  24.56 
 
 		 593 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  24.74 
 
 		 767 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  23.38 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  21.36 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  24.15 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  23.19 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  22.79 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  23.92 
 
 		 1005 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  33.14 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  23.13 
 
 		 591 aa  60.5  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  22.72 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  22.72 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  21.96 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  23.3 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  23.12 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  23.66 
 
 		 1100 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>