More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2552 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  100 
 
 		 147 aa  306  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  95.24 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  75.34 
 
 		 147 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  64.83 
 
 		 149 aa  214  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  65.52 
 
 		 149 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  63.01 
 
 		 151 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  64.38 
 
 		 148 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  58.22 
 
 		 151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  42.76 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  42.76 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  42.18 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  40.14 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.33 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  35.86 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  36.55 
 
 		 143 aa  94.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  36.43 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 308 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  36.24 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.9 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.48 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  38.46 
 
 		 320 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  38.19 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.97 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  33.81 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.06 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.62 
 
 		 180 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  33.1 
 
 		 307 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  36.91 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  33.8 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  37.24 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  37.24 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  37.24 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  33.11 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.03 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  34.42 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  33.1 
 
 		 287 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  32.37 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  34.42 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.67 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  33.1 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  37.33 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  34.27 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.57 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.01 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.1 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.01 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.99 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.03 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  32.41 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.17 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.42 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.87 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.19 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.01 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.69 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  31.88 
 
 		 285 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.55 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  33.53 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.28 
 
 		 288 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0850  universal stress protein UspA  35.86 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.33 
 
 		 415 aa  74.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.17 
 
 		 290 aa  73.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  31.03 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  28.87 
 
 		 296 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  34.97 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.55 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  32.39 
 
 		 283 aa  73.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>