202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1855 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



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Replicon accession
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Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1855  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2363  VacJ family lipoprotein  93.13 
 
 		 262 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  71.98 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  59.05 
 
 		 252 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  48.17 
 
 		 747 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.4612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  39.92 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  43.72 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  47.83 
 
 		 270 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  48.31 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  45.59 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  45.1 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  43 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  43 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  42.51 
 
 		 274 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  41.63 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  43.07 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  45.15 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  43.41 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  42.36 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  38.31 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  38.81 
 
 		 234 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  38.31 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  38.61 
 
 		 234 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  36.07 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  37.89 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  37.38 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  35.32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  40 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  34.33 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  33.95 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  33.83 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  34 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  34.5 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  35.12 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  33.33 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  31.25 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  37.32 
 
 		 317 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  38.07 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  38.5 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  34.8 
 
 		 311 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  42 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  42 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  42 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  42 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  42 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  42 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  42 
 
 		 319 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  37.17 
 
 		 340 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  36.65 
 
 		 338 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  34.31 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  37.75 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  34.12 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  36.9 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  32.85 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  31.17 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  30.24 
 
 		 315 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  32.52 
 
 		 325 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  32.04 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  32.04 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  32.04 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  32.04 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  32.2 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  32.2 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0561  surface lipoprotein-like  30.33 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.361173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  34.43 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  33.98 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  33.99 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  35.71 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  38.93 
 
 		 336 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  35.16 
 
 		 329 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  39.42 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  32.04 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  31.68 
 
 		 347 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  30.53 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  35.56 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  34.62 
 
 		 347 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  34.62 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_0980  VacJ family lipoprotein  41.22 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3037  surface lipoprotein-like protein  33.49 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  34.62 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
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NC_011138  MADE_03065  Surface lipoprotein  32.28 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  35.56 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  31.2 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  34.62 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  34.62 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
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NC_004347  SO_3197  vacJ lipoprotein, putative  31.28 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_2907  VacJ family lipoprotein  33.97 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10764  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  31.91 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  39.77 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  30.65 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  35.32 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  34.5 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  35.32 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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