More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1701 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1701  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 371 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16166  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3207  3-dehydroquinate synthase  77.84 
 
 		 362 aa  544  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0774582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  62.64 
 
 		 370 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1835  3-dehydroquinate synthase  57.57 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15460  3-dehydroquinate synthase  57.46 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2272  3-dehydroquinate synthase  59.07 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  58.04 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3013  3-dehydroquinate synthase  59.17 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12660  3-dehydroquinate synthase  60.52 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.3799  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1092  3-dehydroquinate synthase  59.08 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  58.22 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  56.67 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17870  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.092005  normal  0.568716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12558  3-dehydroquinate synthase  58 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354876  normal  0.184174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2647  3-dehydroquinate synthase  57.43 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5253  3-dehydroquinate synthase  57.71 
 
 		 368 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528317  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1334  3-dehydroquinate synthase  56.75 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.904489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3756  3-dehydroquinate synthase  56.16 
 
 		 359 aa  362  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 577 aa  362  8e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  53.95 
 
 		 371 aa  362  8e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2327  3-dehydroquinate synthase  53.13 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0204602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4296  3-dehydroquinate synthase  57.98 
 
 		 371 aa  359  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.67949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2354  3-dehydroquinate synthase  58.62 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2395  3-dehydroquinate synthase  58.62 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0139628  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2401  3-dehydroquinate synthase  58.62 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0377427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15030  3-dehydroquinate synthase  55.65 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0034705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2208  3-dehydroquinate synthase  54.44 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.441501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0878  3-dehydroquinate synthase  57.82 
 
 		 366 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3151  3-dehydroquinate synthase  57.39 
 
 		 353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1840  3-dehydroquinate synthase  54.97 
 
 		 357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.766033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  56.02 
 
 		 361 aa  338  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1847  3-dehydroquinate synthase  56.29 
 
 		 357 aa  335  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 		 519 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  50.98 
 
 		 365 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  47.27 
 
 		 540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  42.93 
 
 		 560 aa  290  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  45.43 
 
 		 593 aa  263  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  39.35 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  43.48 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.13 
 
 		 364 aa  229  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  43.62 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  45.22 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  34.82 
 
 		 363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  35.75 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  41.24 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1450  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  41.24 
 
 		 370 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  39.05 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 		 370 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 		 369 aa  222  7e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  33.7 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 		 365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  41.62 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  42.34 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 		 376 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  41.21 
 
 		 373 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  38.01 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 359 aa  219  7.999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  45.91 
 
 		 368 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  46.9 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  38.99 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  40.39 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  43.28 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  36.2 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  39.82 
 
 		 358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 		 369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  45.02 
 
 		 366 aa  216  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  42.66 
 
 		 372 aa  215  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  42.22 
 
 		 368 aa  215  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  42.58 
 
 		 370 aa  215  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  37.2 
 
 		 367 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  38.05 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.92 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  41.67 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  41.02 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  34.13 
 
 		 351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  42.51 
 
 		 367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  38.99 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  34.69 
 
 		 353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  37.59 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 361 aa  212  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  39.47 
 
 		 372 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  42.76 
 
 		 388 aa  212  7.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 		 388 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  43.64 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  42.73 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  41.21 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  43.75 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  32.75 
 
 		 352 aa  209  4e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>