More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4297 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  100 
 
 		 422 aa  805    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  68.61 
 
 		 514 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  61.89 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  53.85 
 
 		 389 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  59.29 
 
 		 389 aa  309  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  54.2 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  59.94 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  58.15 
 
 		 395 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  63.4 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  61.98 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  55.02 
 
 		 352 aa  296  6e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  56.92 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  56.92 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  60.96 
 
 		 398 aa  292  7e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  56.01 
 
 		 388 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  58.17 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  57.1 
 
 		 398 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  45.3 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  49.15 
 
 		 444 aa  282  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  47.78 
 
 		 453 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  55.88 
 
 		 390 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  48.12 
 
 		 462 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  46.6 
 
 		 463 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  47.78 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  55.66 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  48.46 
 
 		 454 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  41.46 
 
 		 441 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  47.78 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  44.71 
 
 		 479 aa  275  7e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  47.78 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  47.44 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  45.86 
 
 		 478 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  43.14 
 
 		 463 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  47.59 
 
 		 624 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  44.55 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  47.78 
 
 		 455 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  46.43 
 
 		 445 aa  272  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  47.78 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  47.78 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  47.44 
 
 		 466 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  45.39 
 
 		 468 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  44.71 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  47.1 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  41.97 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  48.62 
 
 		 515 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  46.76 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  46.94 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  48.62 
 
 		 474 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  48.28 
 
 		 520 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  51.7 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  48.28 
 
 		 520 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  48.28 
 
 		 520 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  48.28 
 
 		 521 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  48.28 
 
 		 523 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  48.28 
 
 		 523 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  45.39 
 
 		 464 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  46.26 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  42.16 
 
 		 481 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  46.33 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  46.42 
 
 		 455 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  46.42 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  45.73 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  46.08 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  46.42 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  46.42 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  47.93 
 
 		 472 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  46.42 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  44.71 
 
 		 472 aa  266  7e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  42.16 
 
 		 572 aa  266  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  47.93 
 
 		 472 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  48.12 
 
 		 450 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  47.44 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  48.12 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  61.82 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  45.73 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  42.41 
 
 		 484 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  55.66 
 
 		 492 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 490 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 482 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  45.24 
 
 		 463 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  44.02 
 
 		 468 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  44.03 
 
 		 569 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  54.55 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  43.1 
 
 		 433 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 491 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  44.37 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  43.77 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  46.47 
 
 		 471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  40.3 
 
 		 500 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  45.36 
 
 		 608 aa  259  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  42.66 
 
 		 451 aa  259  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  45.05 
 
 		 458 aa  259  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  56.18 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  43.57 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  45.39 
 
 		 496 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  42.41 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  54.47 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  41.38 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>