More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3863 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 334 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  81.48 
 
 		 343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  66.23 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  62.21 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  62.46 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  56.23 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.46 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  46.51 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.46 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  45.7 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  42.4 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  43.38 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  40.18 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.51 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  42.44 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  37.46 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  41.37 
 
 		 345 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  38.49 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.18 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.42 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.21 
 
 		 318 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  41.16 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.6 
 
 		 324 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.11 
 
 		 476 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  37.76 
 
 		 476 aa  179  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  40.25 
 
 		 423 aa  179  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  38.31 
 
 		 420 aa  179  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.29 
 
 		 364 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.71 
 
 		 476 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  33.33 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  38.73 
 
 		 473 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  35.13 
 
 		 474 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.71 
 
 		 381 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  43.11 
 
 		 485 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.35 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  39.36 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.49 
 
 		 416 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.35 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.91 
 
 		 410 aa  172  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.03 
 
 		 502 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  37.76 
 
 		 505 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  38.93 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  38.93 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.14 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.86 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  37.2 
 
 		 415 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.41 
 
 		 464 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  39.21 
 
 		 472 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.16 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  39.27 
 
 		 503 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.67 
 
 		 475 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.63 
 
 		 478 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.53 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.35 
 
 		 500 aa  169  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  35.61 
 
 		 472 aa  169  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  36.17 
 
 		 408 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  39.01 
 
 		 388 aa  168  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.52 
 
 		 471 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.14 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  38.46 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  36.17 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  38.79 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  42.18 
 
 		 458 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  37.06 
 
 		 503 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.32 
 
 		 466 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  42.45 
 
 		 535 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  38.98 
 
 		 471 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  39.19 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  38.46 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  37.5 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  41.02 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  37.06 
 
 		 503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.21 
 
 		 483 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  40.74 
 
 		 511 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.07 
 
 		 487 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  40 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  42.41 
 
 		 385 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  38.18 
 
 		 504 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  36.81 
 
 		 388 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  36.81 
 
 		 402 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.35 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  39.6 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  34.82 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  34.18 
 
 		 494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  38.1 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.08 
 
 		 401 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  38.08 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  36.81 
 
 		 402 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.08 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  36.81 
 
 		 402 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.08 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  36.81 
 
 		 402 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  40 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  36.79 
 
 		 409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  40.14 
 
 		 483 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  34.27 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.44 
 
 		 415 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.41 
 
 		 474 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  39.01 
 
 		 506 aa  162  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  39.69 
 
 		 386 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>