153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3745 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1694 aa  3278    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  38.16 
 
 		 1410 aa  675    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  41.19 
 
 		 1575 aa  970    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  38.45 
 
 		 1387 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  60.93 
 
 		 2622 aa  949    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  27.86 
 
 		 1630 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  33.61 
 
 		 1622 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  32.5 
 
 		 1790 aa  416  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  38.81 
 
 		 1489 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  35.54 
 
 		 1490 aa  413  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1724 aa  324  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1474 aa  301  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  39.29 
 
 		 1523 aa  294  9e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  34.83 
 
 		 1629 aa  280  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  35.93 
 
 		 1697 aa  265  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  37.99 
 
 		 1652 aa  263  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  35.73 
 
 		 1649 aa  257  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  30.54 
 
 		 1557 aa  135  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  27.9 
 
 		 1958 aa  110  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  28.09 
 
 		 1950 aa  110  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  25.06 
 
 		 907 aa  107  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  30.22 
 
 		 1980 aa  105  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  27.56 
 
 		 908 aa  105  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1823 aa  104  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.4 
 
 		 900 aa  102  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  25.61 
 
 		 905 aa  101  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  25.61 
 
 		 905 aa  101  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  26.88 
 
 		 905 aa  101  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  25.06 
 
 		 905 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25.44 
 
 		 905 aa  100  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  27.56 
 
 		 1973 aa  99  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1722 aa  98.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  27.44 
 
 		 1991 aa  97.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  27.15 
 
 		 2002 aa  96.7  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  26.96 
 
 		 2197 aa  94.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  27.1 
 
 		 1803 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  27.8 
 
 		 1559 aa  94  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  27.18 
 
 		 2204 aa  94  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  27.99 
 
 		 2045 aa  93.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  27.21 
 
 		 2207 aa  92.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  27.94 
 
 		 1571 aa  90.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  29.22 
 
 		 1861 aa  90.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  25.99 
 
 		 2198 aa  89.4  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  25.35 
 
 		 1559 aa  88.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.14 
 
 		 1853 aa  88.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  27.5 
 
 		 1958 aa  88.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.91 
 
 		 1203 aa  87.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  26.46 
 
 		 906 aa  87.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25 
 
 		 1403 aa  87  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  25.75 
 
 		 1121 aa  86.3  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  26.71 
 
 		 2016 aa  84.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  25.83 
 
 		 1622 aa  83.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 		 2101 aa  82.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 		 2101 aa  82.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 		 2098 aa  82.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 2104 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  26.15 
 
 		 2123 aa  81.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.54 
 
 		 1986 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  26.61 
 
 		 2096 aa  80.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  25.54 
 
 		 2098 aa  80.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  30.15 
 
 		 1867 aa  80.5  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  25.54 
 
 		 2098 aa  80.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1854 aa  80.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  26.68 
 
 		 2222 aa  79.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  25.99 
 
 		 1945 aa  79  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1328 aa  79  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  23.09 
 
 		 1081 aa  77.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  26.67 
 
 		 1983 aa  76.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  28.05 
 
 		 2125 aa  76.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  20.58 
 
 		 1367 aa  76.3  0.000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  28.05 
 
 		 2125 aa  76.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  24.89 
 
 		 2759 aa  75.9  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.11 
 
 		 1959 aa  75.5  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1888 aa  74.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  25.21 
 
 		 2013 aa  74.7  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1801 aa  74.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  23.89 
 
 		 1754 aa  72.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  26.67 
 
 		 1296 aa  72  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  25.66 
 
 		 903 aa  70.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  26.34 
 
 		 1589 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1575 aa  69.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1589 aa  68.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  23.73 
 
 		 1822 aa  68.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1589 aa  68.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1680 aa  67.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.23 
 
 		 606 aa  66.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  30.86 
 
 		 2005 aa  66.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  24.12 
 
 		 1593 aa  66.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 1196 aa  64.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  28.38 
 
 		 946 aa  63.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  27.81 
 
 		 1328 aa  62.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1904 aa  61.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  46.15 
 
 		 1572 aa  60.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  28.69 
 
 		 1126 aa  61.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1822 aa  60.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.69 
 
 		 932 aa  60.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.7 
 
 		 1363 aa  60.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  25.98 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.62 
 
 		 916 aa  59.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1763 aa  59.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>