44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1299 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  41.49 
 
 
1680 aa  1113    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  100 
 
 
1763 aa  3459    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  30.82 
 
 
1629 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  31.27 
 
 
1649 aa  475  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  27.14 
 
 
1652 aa  269  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  26.07 
 
 
1697 aa  256  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  39.85 
 
 
534 aa  171  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  40.29 
 
 
540 aa  168  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  40.78 
 
 
553 aa  163  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  44.33 
 
 
541 aa  162  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  39.38 
 
 
518 aa  160  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  39.77 
 
 
546 aa  157  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  40.85 
 
 
540 aa  152  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  46.29 
 
 
472 aa  150  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  36.52 
 
 
544 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  21.26 
 
 
1474 aa  119  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  38.2 
 
 
460 aa  118  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  34.72 
 
 
841 aa  107  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  34.3 
 
 
766 aa  105  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  32.39 
 
 
836 aa  104  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  30.27 
 
 
715 aa  103  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  34.22 
 
 
409 aa  102  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  34.48 
 
 
414 aa  99  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  30.43 
 
 
465 aa  98.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  30.43 
 
 
465 aa  98.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  32.31 
 
 
493 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
496 aa  93.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  31.69 
 
 
479 aa  90.1  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  32.95 
 
 
634 aa  85.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  25.09 
 
 
1575 aa  79  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  28.73 
 
 
1523 aa  78.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  27.9 
 
 
499 aa  77.4  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  21.99 
 
 
1630 aa  76.6  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  25.74 
 
 
1724 aa  75.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  28.68 
 
 
1790 aa  70.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  37.21 
 
 
1694 aa  58.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  28.75 
 
 
1557 aa  58.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  39.29 
 
 
2622 aa  57.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  27.66 
 
 
1622 aa  56.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  25.11 
 
 
1489 aa  56.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  36.27 
 
 
1387 aa  54.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  21.93 
 
 
1490 aa  53.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  28.07 
 
 
1410 aa  47.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  26.92 
 
 
1945 aa  47  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>