235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4515 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  100 
 
 		 469 aa  964    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  60.76 
 
 		 476 aa  611  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0521  ATP-dependent exodeoxyribonuclease  55.6 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1469  exonuclease V subunit alpha  45.42 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  48.18 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  45.38 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  45.41 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  39.35 
 
 		 471 aa  353  5e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1226  exonuclease V subunit alpha  34.22 
 
 		 924 aa  236  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3509  exonuclease V subunit alpha  34.22 
 
 		 924 aa  236  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  35.08 
 
 		 754 aa  213  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2955  hypothetical protein  31.76 
 
 		 488 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0703173  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  29.15 
 
 		 678 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  27.17 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  26.5 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  26.49 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  26.73 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  26.02 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  26.18 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  25.7 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  25.44 
 
 		 368 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  24.62 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  25.75 
 
 		 375 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  24.94 
 
 		 363 aa  97.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  27.9 
 
 		 365 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  25 
 
 		 369 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  25.11 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  24.79 
 
 		 373 aa  94.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  24.73 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  24.63 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  26.68 
 
 		 365 aa  94  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  25.61 
 
 		 369 aa  93.6  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  25.33 
 
 		 369 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3837  putative deoxyribonuclease  25.5 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  27.16 
 
 		 813 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  26.12 
 
 		 365 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  26.01 
 
 		 365 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  24.18 
 
 		 369 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  24.57 
 
 		 369 aa  90.1  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  25 
 
 		 363 aa  89  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  24.89 
 
 		 369 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  26.75 
 
 		 735 aa  87  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2622  putative deoxyribonuclease  24.39 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  27.84 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  36.57 
 
 		 738 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  24.67 
 
 		 746 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  24.17 
 
 		 741 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4089  putative deoxyribonuclease  23.73 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  31.41 
 
 		 742 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  32.29 
 
 		 761 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  30.32 
 
 		 728 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  32.43 
 
 		 727 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  31.79 
 
 		 744 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  30.81 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  28.29 
 
 		 738 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  31.64 
 
 		 739 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  31.18 
 
 		 740 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  32.76 
 
 		 728 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  30.22 
 
 		 731 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  24.27 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  31.79 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  24.32 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  30.11 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  27.65 
 
 		 659 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  31.03 
 
 		 738 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  30.22 
 
 		 740 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  30.11 
 
 		 768 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 728 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5834  DNA helicase, putative  27.09 
 
 		 462 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  26.44 
 
 		 806 aa  66.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  28.98 
 
 		 742 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  29.32 
 
 		 720 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  29.48 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  29.61 
 
 		 1214 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  29.44 
 
 		 736 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  32.99 
 
 		 728 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  24.65 
 
 		 745 aa  65.1  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  32.16 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  31.96 
 
 		 653 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  31.3 
 
 		 726 aa  64.7  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  30.66 
 
 		 762 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  33.58 
 
 		 923 aa  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  27.73 
 
 		 784 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  34.13 
 
 		 719 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  29.89 
 
 		 749 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  31.79 
 
 		 739 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1106  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.98 
 
 		 766 aa  63.2  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.710549  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  31.84 
 
 		 747 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  23.95 
 
 		 728 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  29.41 
 
 		 711 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  28.81 
 
 		 736 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  28.81 
 
 		 735 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  29.45 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  27.32 
 
 		 786 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  29.31 
 
 		 733 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  35.23 
 
 		 749 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  31.9 
 
 		 726 aa  61.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  29.48 
 
 		 750 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  22.38 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  24.42 
 
 		 742 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>