More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2042 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 886 aa  1818    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  39.19 
 
 		 966 aa  581  1e-164  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  33.4 
 
 		 904 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  32.97 
 
 		 875 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  34.69 
 
 		 882 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  33.49 
 
 		 889 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  34.16 
 
 		 882 aa  399  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  32.21 
 
 		 881 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  31.3 
 
 		 864 aa  386  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  32.82 
 
 		 893 aa  382  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  31.94 
 
 		 914 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  31.27 
 
 		 902 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  32.05 
 
 		 915 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 831 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  34.18 
 
 		 898 aa  365  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  31.31 
 
 		 849 aa  359  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.27 
 
 		 814 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.9 
 
 		 807 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.53 
 
 		 820 aa  346  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  30.43 
 
 		 823 aa  341  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  42.59 
 
 		 778 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  41.18 
 
 		 790 aa  322  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  39.96 
 
 		 805 aa  320  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  42.45 
 
 		 778 aa  320  7.999999999999999e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.39 
 
 		 927 aa  313  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  39.62 
 
 		 777 aa  310  5.9999999999999995e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.4 
 
 		 756 aa  308  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  41.4 
 
 		 772 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.21 
 
 		 792 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.41 
 
 		 762 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.39 
 
 		 795 aa  298  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  36.76 
 
 		 808 aa  296  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  29.43 
 
 		 913 aa  295  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  28.49 
 
 		 887 aa  294  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  29 
 
 		 897 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 913 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.02 
 
 		 782 aa  289  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  29.07 
 
 		 913 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.59 
 
 		 784 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  35.24 
 
 		 859 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  28.71 
 
 		 884 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  29.37 
 
 		 866 aa  282  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.21 
 
 		 771 aa  281  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  30.16 
 
 		 839 aa  281  3e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  28.63 
 
 		 972 aa  280  8e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  29.75 
 
 		 851 aa  280  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  28.71 
 
 		 843 aa  278  3e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  29 
 
 		 845 aa  278  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.75 
 
 		 754 aa  277  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  36.32 
 
 		 772 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  27.98 
 
 		 857 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  29.22 
 
 		 988 aa  272  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  28.28 
 
 		 906 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.48 
 
 		 757 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  27.93 
 
 		 838 aa  269  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.38 
 
 		 783 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.98 
 
 		 769 aa  266  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.46 
 
 		 766 aa  265  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.15 
 
 		 762 aa  264  4.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.86 
 
 		 755 aa  264  4.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  27.02 
 
 		 832 aa  264  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.72 
 
 		 760 aa  263  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  28.32 
 
 		 870 aa  263  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.47 
 
 		 769 aa  262  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.77 
 
 		 799 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.02 
 
 		 902 aa  261  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  28.28 
 
 		 927 aa  259  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  27.86 
 
 		 833 aa  259  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  34.08 
 
 		 743 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.53 
 
 		 749 aa  258  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  36.36 
 
 		 758 aa  258  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  38.52 
 
 		 743 aa  257  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.44 
 
 		 801 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  34.27 
 
 		 766 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.38 
 
 		 768 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  28 
 
 		 843 aa  254  4.0000000000000004e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  28.68 
 
 		 772 aa  254  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  35.07 
 
 		 740 aa  253  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  37.14 
 
 		 750 aa  252  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  48.55 
 
 		 765 aa  252  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  34.86 
 
 		 802 aa  251  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.78 
 
 		 768 aa  251  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34 
 
 		 751 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  34.53 
 
 		 765 aa  249  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  28.12 
 
 		 897 aa  248  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.62 
 
 		 736 aa  248  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  36.19 
 
 		 738 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  29.29 
 
 		 832 aa  246  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.09 
 
 		 760 aa  244  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.9 
 
 		 751 aa  244  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  35.68 
 
 		 811 aa  244  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  35.43 
 
 		 820 aa  243  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.78 
 
 		 806 aa  243  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  43.84 
 
 		 763 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  34.01 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  34.01 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  33.83 
 
 		 737 aa  242  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  34.01 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  27.69 
 
 		 836 aa  241  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  42.96 
 
 		 774 aa  241  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>