More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1709 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1709  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  100 
 
 		 272 aa  565  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1429  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  82.29 
 
 		 280 aa  470  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2029  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  82.29 
 
 		 280 aa  470  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1444  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  82.29 
 
 		 280 aa  470  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1412  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  82.29 
 
 		 280 aa  470  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.035912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1856  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  82.29 
 
 		 280 aa  470  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.348031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  80.07 
 
 		 280 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  80.07 
 
 		 279 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  80.07 
 
 		 280 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  79.7 
 
 		 279 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  79.7 
 
 		 279 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  79.7 
 
 		 279 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  79.7 
 
 		 279 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  79.34 
 
 		 279 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0837  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  64.15 
 
 		 287 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126222 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3571  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  62.31 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000174355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1094  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  62.31 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1147  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  62.31 
 
 		 280 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0420293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5606  transcriptional regulator, AraC family  23.38 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0545512  normal  0.986843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2481  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0594391  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.34 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  22.49 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0079  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3015  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103584  normal  0.15969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  35.37 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  30.4 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0094  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  28.91 
 
 		 934 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  27.2 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  39.19 
 
 		 1201 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  20.63 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  40.28 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0928  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  22 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  26.09 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  24.85 
 
 		 513 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1945  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  26.09 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1341 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2883  transcriptional regulator, AraC family  22.09 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000839866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  23.47 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 316 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 335 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  24.32 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  20 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3846  transcriptional regulator, AraC family  23.83 
 
 		 381 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0222  Ada family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 452 aa  52.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 385 aa  52.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 286 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.44 
 
 		 323 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  30.86 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.1 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  49.06 
 
 		 412 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.56 
 
 		 389 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 515 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>