274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0137 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0087  cytochrome c assembly protein  77.8 
 
 
644 aa  1005    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0137  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  100 
 
 
645 aa  1281    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.021229  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0232  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF, putative  49.91 
 
 
708 aa  536  1e-151  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2003  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.22 
 
 
660 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.151037  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3448  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.83 
 
 
660 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186269  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39 
 
 
661 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.157027  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1439  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  39.33 
 
 
660 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1836  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.52 
 
 
660 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0373548  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2132  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.36 
 
 
660 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4051  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.89 
 
 
666 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.663155  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3775  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.89 
 
 
666 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3411  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  37.82 
 
 
664 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276994  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1071  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  38.13 
 
 
665 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.998298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0922  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.87 
 
 
662 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606088  normal  0.0314376 
 
 
-
 
NC_004310  BR0609  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.58 
 
 
663 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.42 
 
 
663 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2669  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.86 
 
 
663 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1364  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.44 
 
 
667 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0035  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.25 
 
 
671 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.836519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2232  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.75 
 
 
660 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0040  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.75 
 
 
657 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1513  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.26 
 
 
639 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.71 
 
 
661 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.018137  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1659  cytochrome c assembly protein  34.96 
 
 
659 aa  389  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118924  normal  0.550296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.59 
 
 
666 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108903 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3977  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.99 
 
 
653 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0556794  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4166  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.75 
 
 
664 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3073  cytochrome c-type biogenesis protein cycK  36.64 
 
 
659 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.46047  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0438  cytochrome c assembly protein  35.97 
 
 
660 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1406  cytochrome c assembly protein  36.59 
 
 
666 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.419457  normal  0.0330583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1681  cytochrome c assembly protein  36.18 
 
 
666 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0360404  normal  0.640994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1401  cytochrome c assembly protein  36.93 
 
 
666 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0545424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4431  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.02 
 
 
660 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.938091  normal  0.729062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2152  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.02 
 
 
662 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1378  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.59 
 
 
639 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0432  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  38.29 
 
 
659 aa  376  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3999  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.39 
 
 
658 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.509835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2786  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.07 
 
 
657 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0899  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.67 
 
 
662 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3891  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.18 
 
 
658 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109986  normal  0.46196 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2276  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.78 
 
 
652 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1640  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.23 
 
 
651 aa  372  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0476911  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1209  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.66 
 
 
679 aa  372  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0941  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.37 
 
 
660 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.983495  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0923  cytochrome C-type biogenesis protein CcmF  36.29 
 
 
650 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1169  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.89 
 
 
656 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.291829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1127  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.91 
 
 
654 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0635  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.68 
 
 
660 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181407  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0892  cytochrome C-type biogenesis protein CcmF  35.97 
 
 
650 aa  365  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1035  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.88 
 
 
679 aa  365  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0398  cytochrome c-type biogenesis protein F  35.89 
 
 
649 aa  364  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3566  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.24 
 
 
660 aa  364  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0145214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4656  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.69 
 
 
659 aa  362  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724675  hitchhiker  0.00321654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2633  cytochrome c maturation protein, CcmF  37.48 
 
 
656 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0466385  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1290  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.48 
 
 
656 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.595992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3630  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.87 
 
 
657 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.23 
 
 
677 aa  360  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1871  cytochrome C-type biogenesis protein CcmF  33.92 
 
 
675 aa  360  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0677969  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1582  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.57 
 
 
662 aa  359  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3019  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34 
 
 
653 aa  359  9e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4284  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.38 
 
 
659 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1411  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.82 
 
 
694 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3388  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.17 
 
 
657 aa  357  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609216  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0802  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.74 
 
 
649 aa  356  7.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.73075  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.27 
 
 
658 aa  353  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000108567  normal  0.0553743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3847  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.51 
 
 
657 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2446  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.78 
 
 
672 aa  353  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1501  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.85 
 
 
656 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.175478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.85 
 
 
656 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002846  cytochrome c heme lyase subunit CcmF  34.65 
 
 
658 aa  351  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0390  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.85 
 
 
656 aa  351  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.458476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0248  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.93 
 
 
658 aa  351  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00203639  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4770  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.88 
 
 
673 aa  350  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.43 
 
 
659 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.43 
 
 
659 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000102489  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.43 
 
 
659 aa  349  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4021  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.47 
 
 
659 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000531805  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2852  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.43 
 
 
672 aa  348  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03130  hypothetical protein  35.13 
 
 
660 aa  348  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03069  Cytochrome c biogenesis factor  33.72 
 
 
685 aa  348  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.7 
 
 
664 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1549  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.84 
 
 
660 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3724  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.55 
 
 
659 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00953615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0943  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.81 
 
 
661 aa  345  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1955  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.74 
 
 
665 aa  344  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0374  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.33 
 
 
692 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720361 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1743  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.55 
 
 
681 aa  343  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.262796  normal  0.222748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2854  cytochrome c assembly protein  33.28 
 
 
657 aa  342  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0182  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.69 
 
 
656 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00179413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0585  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.57 
 
 
665 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971305  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1516  cytochrome c assembly protein  33.77 
 
 
656 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3648  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.62 
 
 
662 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2419  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.93 
 
 
651 aa  340  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2723  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.25 
 
 
651 aa  340  7e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2384  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.73 
 
 
643 aa  339  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4042  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.73 
 
 
643 aa  339  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3386  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.95 
 
 
656 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2495  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.68 
 
 
647 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2334  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.68 
 
 
647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2489  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.73 
 
 
643 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0165836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>