270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0232 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0232  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF, putative  100 
 
 
708 aa  1427    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0087  cytochrome c assembly protein  45.01 
 
 
644 aa  567  1e-160  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0137  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  49.01 
 
 
645 aa  511  1e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.021229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.15 
 
 
666 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2003  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.85 
 
 
660 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.151037  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3977  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.24 
 
 
653 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0556794  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3775  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.16 
 
 
666 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4051  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.16 
 
 
666 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.663155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2132  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.49 
 
 
660 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1401  cytochrome c assembly protein  35.88 
 
 
666 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0545424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1681  cytochrome c assembly protein  35.33 
 
 
666 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0360404  normal  0.640994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1406  cytochrome c assembly protein  35.05 
 
 
666 aa  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.419457  normal  0.0330583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1836  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.04 
 
 
660 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0373548  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0438  cytochrome c assembly protein  36.08 
 
 
660 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0040  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.15 
 
 
657 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4166  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.13 
 
 
664 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522629  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1659  cytochrome c assembly protein  34.41 
 
 
659 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118924  normal  0.550296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.97 
 
 
661 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.018137  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3411  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  33.76 
 
 
664 aa  379  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276994  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2669  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.54 
 
 
663 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2232  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.97 
 
 
660 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1209  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.19 
 
 
679 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4431  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.64 
 
 
660 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.938091  normal  0.729062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0922  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.98 
 
 
662 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0606088  normal  0.0314376 
 
 
-
 
NC_004310  BR0609  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.44 
 
 
663 aa  362  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.7 
 
 
664 aa  362  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1071  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.82 
 
 
665 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.998298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1439  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.65 
 
 
660 aa  362  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.3 
 
 
663 aa  361  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3891  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.7 
 
 
658 aa  359  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109986  normal  0.46196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3999  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.52 
 
 
658 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.509835  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1127  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.3 
 
 
654 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0432  cytochrome c-type biogenesis protein CycK  34.83 
 
 
659 aa  357  5.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1378  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.63 
 
 
639 aa  353  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1364  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.27 
 
 
667 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3073  cytochrome c-type biogenesis protein cycK  33.89 
 
 
659 aa  352  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.46047  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1411  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.84 
 
 
694 aa  349  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2152  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  29.48 
 
 
662 aa  348  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0635  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.38 
 
 
660 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181407  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1640  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.27 
 
 
651 aa  347  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0476911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0035  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.76 
 
 
671 aa  347  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.836519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0899  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  34.45 
 
 
662 aa  347  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0941  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.85 
 
 
660 aa  346  8e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.983495  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1743  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.28 
 
 
681 aa  345  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.262796  normal  0.222748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2723  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.6 
 
 
651 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3019  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.4 
 
 
653 aa  344  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0892  cytochrome C-type biogenesis protein CcmF  32.45 
 
 
650 aa  344  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1035  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.25 
 
 
679 aa  343  5.999999999999999e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2786  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.16 
 
 
657 aa  343  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.35 
 
 
656 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0923  cytochrome C-type biogenesis protein CcmF  32.59 
 
 
650 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2419  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.35 
 
 
651 aa  342  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3448  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.61 
 
 
660 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186269  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1501  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.35 
 
 
656 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.175478  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03069  Cytochrome c biogenesis factor  30.36 
 
 
685 aa  341  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0390  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.35 
 
 
656 aa  341  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.458476 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2276  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.22 
 
 
652 aa  340  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2390  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.35 
 
 
653 aa  340  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175562  hitchhiker  0.0000318804 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0802  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  36.09 
 
 
649 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.73075  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1193  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  35.62 
 
 
661 aa  337  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.157027  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1513  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  37.48 
 
 
639 aa  337  5.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2852  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.52 
 
 
672 aa  336  9e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0585  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33.47 
 
 
665 aa  336  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971305  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0398  cytochrome c-type biogenesis protein F  36.77 
 
 
649 aa  335  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1955  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  33 
 
 
665 aa  335  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2446  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.67 
 
 
672 aa  334  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1871  cytochrome C-type biogenesis protein CcmF  31.14 
 
 
675 aa  334  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0677969  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2854  cytochrome c assembly protein  32.03 
 
 
657 aa  333  6e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2495  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.75 
 
 
647 aa  333  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02123  heme lyase, CcmF subunit  30.75 
 
 
647 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1463  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.75 
 
 
647 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.617817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2334  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.75 
 
 
647 aa  332  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02082  hypothetical protein  30.75 
 
 
647 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2344  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.75 
 
 
647 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1516  cytochrome c assembly protein  31.65 
 
 
656 aa  332  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4021  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.77 
 
 
659 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000531805  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1454  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.75 
 
 
647 aa  332  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.494014  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3333  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.75 
 
 
647 aa  332  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002846  cytochrome c heme lyase subunit CcmF  31.65 
 
 
658 aa  331  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.77 
 
 
659 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000102489  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4025  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.04 
 
 
643 aa  330  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.999265  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2475  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.04 
 
 
643 aa  330  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0902035  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.89 
 
 
659 aa  329  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03130  hypothetical protein  32.11 
 
 
660 aa  329  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1211  cytochrome c-type biogenesis protein (CcmF)  32.92 
 
 
661 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0231  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.64 
 
 
659 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0745  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.61 
 
 
647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4204  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.76 
 
 
643 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2592  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.76 
 
 
643 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.233075 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3724  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.77 
 
 
659 aa  327  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00953615  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4042  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.76 
 
 
643 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2384  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.76 
 
 
643 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2433  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.87 
 
 
643 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4097  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  30.87 
 
 
643 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35631  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1369  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  32.17 
 
 
674 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3990  cytochrome c assembly protein  32.97 
 
 
641 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.186912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0229  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.87 
 
 
659 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0413329  hitchhiker  0.00683756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0234  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.87 
 
 
659 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466209  unclonable  0.0000000000673434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1390  cytochrome c assembly protein  31.37 
 
 
655 aa  324  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.74825  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4770  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  31.55 
 
 
673 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>