160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3102 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  100 
 
 		 152 aa  313  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  38.62 
 
 		 210 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  35.06 
 
 		 253 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  37.23 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  35.37 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  39.39 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  31.11 
 
 		 201 aa  77  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  32.65 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  34.25 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  32.65 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  33.85 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  34.62 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  30.14 
 
 		 192 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  32.21 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  34.69 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  30.41 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  29.56 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  30.41 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  32.21 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  29.08 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  31.62 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  31.39 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  28.67 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  31.08 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  29.68 
 
 		 338 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  31.72 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  36.22 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  28.1 
 
 		 183 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  28.1 
 
 		 183 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  28.67 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  27.52 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  32.58 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  29.25 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  34.44 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  30.61 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  25.85 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  28.48 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  29.14 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  32.61 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  34.85 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  29.27 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  28.89 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  30.43 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  41.38 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  29.08 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  32.22 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  27.08 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  28.17 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  28.37 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  26.24 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  29.73 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  27.21 
 
 		 267 aa  57.4  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  28.36 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  27.08 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  24.83 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  30.34 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  32.85 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  27.33 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  28.68 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  28.66 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  29.71 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  31.11 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  29.5 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  26.57 
 
 		 269 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  26.5 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  30.91 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  25.97 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  25.97 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  28.24 
 
 		 199 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  34 
 
 		 271 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 270 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  29.06 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  33.8 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  28.38 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  31.82 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 270 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  24.07 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  26.06 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>