102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3353 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  50.49 
 
 		 820 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  62 
 
 		 795 aa  711    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  54.86 
 
 		 793 aa  674    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  51.54 
 
 		 819 aa  668    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  61.88 
 
 		 795 aa  696    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  62.67 
 
 		 795 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  100 
 
 		 800 aa  1525    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  51.72 
 
 		 821 aa  667    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  58.19 
 
 		 802 aa  749    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  53.67 
 
 		 800 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  52.21 
 
 		 821 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  51.78 
 
 		 821 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  51.04 
 
 		 820 aa  619  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  51.6 
 
 		 821 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  45.06 
 
 		 825 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  48.47 
 
 		 815 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  47.65 
 
 		 819 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  48.24 
 
 		 819 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  47.04 
 
 		 819 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  47.6 
 
 		 820 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  46.73 
 
 		 804 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  46.63 
 
 		 826 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  29.57 
 
 		 817 aa  310  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  31.32 
 
 		 836 aa  301  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.43 
 
 		 817 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  29.07 
 
 		 817 aa  287  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  29.41 
 
 		 879 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  28.77 
 
 		 889 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  29.21 
 
 		 836 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 884 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  29.82 
 
 		 897 aa  260  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  29.08 
 
 		 840 aa  260  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  29.25 
 
 		 889 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  30.37 
 
 		 887 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.44 
 
 		 836 aa  256  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  29.29 
 
 		 887 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  29.8 
 
 		 889 aa  248  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  31.18 
 
 		 850 aa  248  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  28.81 
 
 		 878 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  26.99 
 
 		 865 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  29.65 
 
 		 849 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  29.23 
 
 		 845 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  27.74 
 
 		 803 aa  212  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.37 
 
 		 850 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.79 
 
 		 845 aa  203  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.47 
 
 		 855 aa  201  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.1 
 
 		 849 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  29.4 
 
 		 870 aa  196  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 847 aa  194  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  28.6 
 
 		 866 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 		 839 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  28.52 
 
 		 753 aa  171  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 		 837 aa  170  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 		 847 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  31.21 
 
 		 843 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  24.51 
 
 		 813 aa  151  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 		 846 aa  132  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.51 
 
 		 858 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  31.2 
 
 		 872 aa  119  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  26.1 
 
 		 929 aa  118  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  26.2 
 
 		 857 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  25 
 
 		 846 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.97 
 
 		 858 aa  104  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.04 
 
 		 855 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  34.76 
 
 		 842 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 		 857 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  33.94 
 
 		 842 aa  97.8  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 		 842 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  27.04 
 
 		 855 aa  90.5  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  25.75 
 
 		 867 aa  89  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  26.93 
 
 		 853 aa  89  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.27 
 
 		 844 aa  87.8  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.93 
 
 		 851 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 884 aa  86.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  26.82 
 
 		 868 aa  85.5  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23.53 
 
 		 850 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  31.14 
 
 		 843 aa  77.8  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 		 408 aa  76.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 849 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 835 aa  65.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  26.79 
 
 		 835 aa  65.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 		 849 aa  63.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.24 
 
 		 843 aa  62.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  29.97 
 
 		 877 aa  56.2  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  29.72 
 
 		 877 aa  55.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  22 
 
 		 847 aa  54.7  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  23.6 
 
 		 834 aa  54.3  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.25 
 
 		 855 aa  53.5  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  25.3 
 
 		 866 aa  53.5  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  31.15 
 
 		 841 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.11 
 
 		 842 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.01 
 
 		 439 aa  50.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 		 848 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 		 385 aa  48.9  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  21.61 
 
 		 854 aa  47.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.12 
 
 		 382 aa  47.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 		 385 aa  47.8  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  25.19 
 
 		 787 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1449  hypothetical protein  31.78 
 
 		 378 aa  46.6  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1214  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 		 422 aa  47  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>