More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2356 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 679 aa  1404    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  40.92 
 
 		 663 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  40.62 
 
 		 663 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  33.24 
 
 		 666 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  31.03 
 
 		 661 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4266  protein serine/threonine phosphatase  25.94 
 
 		 614 aa  207  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1841  stage II sporulation E family protein  34.47 
 
 		 616 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  32.22 
 
 		 558 aa  177  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  30.61 
 
 		 556 aa  174  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2273  diguanylate cyclase  31.2 
 
 		 563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3047  serine phosphatase  30.43 
 
 		 397 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3791  diguanylate cyclase  28.29 
 
 		 572 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1786  protein serine/threonine phosphatase  34.46 
 
 		 557 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  34.46 
 
 		 415 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  34.5 
 
 		 414 aa  150  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4125  diguanylate cyclase  28.78 
 
 		 592 aa  150  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1487  diguanylate cyclase  27.6 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0988426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1432  protein serine/threonine phosphatase  31.32 
 
 		 403 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 		 414 aa  148  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2929  serine phosphatase  34.34 
 
 		 410 aa  144  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237417  normal  0.195412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  34.24 
 
 		 410 aa  143  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4586  protein serine/threonine phosphatase  31.9 
 
 		 604 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5579  protein serine/threonine phosphatase  33.72 
 
 		 413 aa  138  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3125  protein serine/threonine phosphatase  31.91 
 
 		 411 aa  137  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0206  diguanylate cyclase  28.24 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0661328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2934  protein serine/threonine phosphatase  31.76 
 
 		 410 aa  119  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1587  protein serine/threonine phosphatase  29.17 
 
 		 459 aa  114  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.661001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  22.4 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  25 
 
 		 630 aa  70.5  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  23.44 
 
 		 644 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  25.38 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  24.71 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  25.51 
 
 		 633 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  24.71 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  21.31 
 
 		 786 aa  67.4  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  26.58 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  24.16 
 
 		 786 aa  67  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  21.39 
 
 		 785 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0613  putative PAS/PAC sensor protein  31.79 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  22.81 
 
 		 1023 aa  65.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  22.37 
 
 		 648 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.23 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4260  sensor histidine kinase/response regulator  26.99 
 
 		 669 aa  62.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25 
 
 		 684 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 691 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 699 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.25 
 
 		 638 aa  62  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  35.59 
 
 		 998 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  22.12 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.98 
 
 		 645 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  25.37 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.98 
 
 		 645 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 977 aa  58.9  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  23.53 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 682 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  34.34 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  34.82 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 		 937 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  23.26 
 
 		 642 aa  57  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  24.13 
 
 		 643 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2369  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  29.29 
 
 		 563 aa  57  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2991  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 677 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  24.42 
 
 		 657 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  24.47 
 
 		 1194 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.81 
 
 		 638 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 585 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  24.6 
 
 		 493 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  24.5 
 
 		 715 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  35.51 
 
 		 646 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  25.2 
 
 		 663 aa  54.3  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  35.06 
 
 		 595 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.11 
 
 		 657 aa  54.3  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  35.06 
 
 		 595 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  21.82 
 
 		 705 aa  53.9  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 346 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  28.57 
 
 		 671 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  24.84 
 
 		 800 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  32.17 
 
 		 673 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27.37 
 
 		 649 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  31.19 
 
 		 561 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 645 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2931  anti-sigma-factor antagonist  28.49 
 
 		 338 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.53 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 588 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.86 
 
 		 643 aa  52.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0151066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0251  diguanylate cyclase  28.79 
 
 		 660 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 593 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 593 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 662 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 		 1397 aa  51.6  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1870  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  33.7 
 
 		 636 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2355  sensor histidine kinase  23.42 
 
 		 482 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 540 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 592 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 674 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  31.43 
 
 		 914 aa  51.6  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2961  hypothetical protein  37.93 
 
 		 561 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.638324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>