229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3001 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  66.82 
 
 		 221 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  49.55 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.5 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.55 
 
 		 247 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.09 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  41.52 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.07 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  41.52 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  40.62 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  40.53 
 
 		 464 aa  164  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  39.29 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  40.18 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  38.46 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  36.65 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.27 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  35.91 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  36.74 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.39 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.91 
 
 		 482 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.18 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.18 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  32.34 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  36.2 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  31.3 
 
 		 492 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  36.2 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.86 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.14 
 
 		 454 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.89 
 
 		 480 aa  99  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.17 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  28.69 
 
 		 521 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  28.88 
 
 		 667 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  50.54 
 
 		 445 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.51 
 
 		 435 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 488 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  30.04 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  28.98 
 
 		 529 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  30.8 
 
 		 509 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  38.52 
 
 		 624 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.63 
 
 		 463 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 297 aa  86.3  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  37.7 
 
 		 605 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.89 
 
 		 503 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  35.03 
 
 		 804 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  25.11 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 505 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  27.35 
 
 		 438 aa  75.1  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  28.76 
 
 		 615 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  23.77 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  24.66 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  23.66 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  32.76 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.3 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  27.56 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  26.79 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  26.79 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1506  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  25.89 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  25.69 
 
 		 477 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  25.89 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  43.24 
 
 		 487 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  25.33 
 
 		 484 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4043  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.362631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  41.43 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  35.14 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  34.18 
 
 		 736 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  27.23 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  37.5 
 
 		 779 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  23.53 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40 
 
 		 720 aa  62  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  32.94 
 
 		 872 aa  62  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  23.53 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  33.65 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  38.81 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  33.98 
 
 		 732 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  50.79 
 
 		 756 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  38.1 
 
 		 756 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  25.35 
 
 		 797 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  28.4 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  39.06 
 
 		 727 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.44 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.08 
 
 		 741 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.63 
 
 		 575 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  26.44 
 
 		 469 aa  58.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.98 
 
 		 730 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  38.16 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  33.01 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 		 734 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.4 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.4 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.4 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>