272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1891 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1891  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 527 aa  1079    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0713  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  51.67 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3043  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  41 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1774  protein of unknown function DUF201  37.72 
 
 		 340 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1773  GCN5-related N-acetyltransferase  46.79 
 
 		 168 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.607515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3044  hypothetical protein  47.9 
 
 		 176 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0714  GCN5-related N-acetyltransferase  52.71 
 
 		 155 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2162  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  28.61 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1506  D-alanine--D-alanine ligase  31.85 
 
 		 728 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.736453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1551  D-alanine--D-alanine ligase  27.65 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0372534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1410  D-alanine--D-alanine ligase  31.85 
 
 		 728 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.801372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1418  D-alanine--D-alanine ligase  30.41 
 
 		 731 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2449  D-alanine--D-alanine ligase  31.21 
 
 		 727 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 637 aa  94.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  27.94 
 
 		 309 aa  93.6  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0135  D-alanine--D-alanine ligase  26.96 
 
 		 336 aa  93.6  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  29.49 
 
 		 308 aa  93.6  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  28.57 
 
 		 663 aa  92.8  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  26.88 
 
 		 347 aa  91.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0081  D-alanine--D-alanine ligase  27.5 
 
 		 310 aa  91.7  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201322  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  24.87 
 
 		 743 aa  91.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 156 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0712  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  26.52 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.396337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1501  hypothetical protein  28.76 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2804  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 		 159 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  22.9 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2749  D-alanine--D-alanine ligase  24.71 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  25.75 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  23.5 
 
 		 354 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  28.21 
 
 		 318 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  26.05 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  25.53 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  25.53 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  25.53 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  25.53 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  25.53 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  25.75 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  27.76 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  25.53 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4020  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.388573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  24.93 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  26.97 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  26.88 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6132  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp protein-like protein  25.53 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  27.92 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  28.17 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3660  D-alanine--D-alanine ligase  28.18 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  26.59 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  28 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  24.92 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  27.11 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  27.2 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  26.59 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  24.92 
 
 		 303 aa  67  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  25.97 
 
 		 316 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  27.49 
 
 		 316 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  25.71 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1238  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 		 155 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  28.29 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  25.97 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  26.23 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  26.03 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2426  D-alanine--D-alanine ligase  24.91 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_570  D-alanine--D-alanine ligase  25.98 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  25.47 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  23.89 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  23.43 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  27.07 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0137  D-alanine/D-alanine ligase  24.78 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000588497  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  24.05 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  25.48 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  24.56 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  25.63 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  23.53 
 
 		 306 aa  62  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  26.09 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  23.1 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  23.16 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  23.16 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  25.65 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  23.05 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  25.32 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0629  D-ala D-ala ligase  25.3 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  24.39 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  28.18 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  23.16 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  23.16 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  23.55 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2111  D-alanine--D-alanine ligase  25.81 
 
 		 307 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1775  D-alanine--D-alanine ligase domain protein  26.44 
 
 		 331 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.286204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0066  D-alanine--D-alanine ligase  26.99 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  26.67 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  23.88 
 
 		 306 aa  60.1  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1724  hypothetical protein  26.73 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.92014  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 164 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  23.16 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  25.81 
 
 		 307 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  25.64 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0695  D-alanine--D-alanine ligase  25.32 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0702  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  22.66 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>