More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2117 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  100 
 
 		 428 aa  823    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.15 
 
 		 407 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2246  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.44 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.829342 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1438  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 		 388 aa  97.8  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  33.18 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.53 
 
 		 432 aa  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.86 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.55 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  30.6 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  29.06 
 
 		 463 aa  87  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  32.51 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.03 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  31.65 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.35 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  27.53 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  31.09 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1133  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0793831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.19 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.29 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  29.79 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0801  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.53 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.67 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.77 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  29.64 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.16 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.75 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.65 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  34.09 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.86 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.43 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  30.73 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  31.74 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  24.52 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  26.46 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  24.23 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  28.43 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.36 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  24.43 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.11 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  28.23 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  30.37 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  30.8 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 352 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  28 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0108  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  30.28 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  26.15 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  26.15 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  28.54 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  25.12 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0859  secretion protein HlyD  32.87 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556695  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  28.44 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  25.67 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  27.78 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  28.63 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 		 496 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  26.42 
 
 		 351 aa  67  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.85 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  28.77 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  31.22 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  31.54 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148727  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  25.87 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  27.23 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00325  cation efflux system protein  26.67 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888841  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  29.11 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.75 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  28.5 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.31 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  33.49 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.68 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.4 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.88 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  26.03 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1475  secretion protein HlyD  28.65 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  27.68 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  23.3 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  24.16 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>