94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5135 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5135  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 448 aa  900    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  31.08 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  30.11 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3233  outer membrane efflux protein  31.24 
 
 		 462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367218  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 431 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0710  Outer membrane protein-like  22.74 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000572058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  24.14 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  23.27 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.45 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.56 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  21.23 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  23.81 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  20.65 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  21.97 
 
 		 500 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4861  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.88 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0310  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.27 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0728642  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  22.86 
 
 		 463 aa  53.5  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.54 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.72 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5361  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.27 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.64 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.24 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1705  Outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.370592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  23.6 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  21.94 
 
 		 463 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.7 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  22.87 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1442  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 738 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.78 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.44 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  20.96 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.26 
 
 		 477 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  23.31 
 
 		 449 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.47 
 
 		 465 aa  47.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.38 
 
 		 460 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.73 
 
 		 463 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.92 
 
 		 477 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  23.58 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.71 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.11 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  22.92 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.44 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  23.36 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  22.96 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  22.62 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.59 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  22.62 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.78 
 
 		 658 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  24.92 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  22.62 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  22.62 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  26.95 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.46 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  23.23 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  23.89 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  23.23 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  24.43 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  22.41 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  23.23 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  26.73 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.33 
 
 		 609 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0007  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.3 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000120725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  20.22 
 
 		 1496 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.42 
 
 		 436 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  24.62 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  24.56 
 
 		 502 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  21.22 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.83 
 
 		 470 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  24.35 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2110  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.89 
 
 		 520 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.78 
 
 		 607 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.92 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>