227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1705 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1705  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 436 aa  874    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.370592  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0457  SapF  23.56 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00255245  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  24.29 
 
 		 442 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  24.22 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  22.46 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  22.8 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.09 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  23 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  24.08 
 
 		 489 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  22.79 
 
 		 470 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  24.08 
 
 		 489 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  24.08 
 
 		 489 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  24.08 
 
 		 489 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  24.08 
 
 		 489 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.67 
 
 		 498 aa  96.7  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  22.13 
 
 		 469 aa  96.7  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  25.06 
 
 		 423 aa  96.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  24.34 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  22.86 
 
 		 497 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  24.67 
 
 		 493 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  23.13 
 
 		 494 aa  94  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  24.27 
 
 		 493 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.27 
 
 		 493 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  24.27 
 
 		 493 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  24.27 
 
 		 495 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  24.27 
 
 		 493 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  24.27 
 
 		 493 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  24.27 
 
 		 495 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  24.27 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  22.77 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.85 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.01 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  22.17 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.79 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.74 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  22.07 
 
 		 432 aa  86.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.06 
 
 		 480 aa  86.7  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.45 
 
 		 465 aa  86.3  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.49 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.09 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.33 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  21.12 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  20.71 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  21.12 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  22.49 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  21.68 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  21.43 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.19 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  21.43 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.88 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.22 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.22 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1726  secretion protein  22.78 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  21.48 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.44 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  21.32 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  22.5 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  21.62 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  21.62 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  21.62 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  18.73 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  21.62 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.14 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  22.72 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20050  putative outer membrane protein  21.9 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.7908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.63 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.97 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  21.56 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.85 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.29 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.94 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.05 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  22.55 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.46 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.96 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  21.64 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.27 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.12 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  22.06 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  21.67 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  21.59 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.92 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  18.85 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  20 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.19 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.39 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.06 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.96 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  22.1 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.65 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.44 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  18.31 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1277  outer membrane protein TolC, putative  22.84 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2905  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.22 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  17.52 
 
 		 489 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.78 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  23.04 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>