228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0457 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0457  SapF  100 
 
 		 433 aa  880    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00255245  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1705  Outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.370592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.49 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.06 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.58 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  26.37 
 
 		 479 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.76 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.77 
 
 		 479 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.51 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.65 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.83 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.82 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.82 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.82 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  24.88 
 
 		 482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.66 
 
 		 498 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  23.8 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.2 
 
 		 497 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.41 
 
 		 469 aa  106  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.28 
 
 		 477 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.68 
 
 		 440 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  24.05 
 
 		 493 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  23.43 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.41 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  24.49 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.76 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.76 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.08 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26 
 
 		 491 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.63 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  23.92 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  23.56 
 
 		 469 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  23.74 
 
 		 489 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  23.74 
 
 		 489 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  23.74 
 
 		 489 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  23.74 
 
 		 489 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  23.74 
 
 		 489 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.78 
 
 		 494 aa  97.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  25 
 
 		 463 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.5 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.91 
 
 		 447 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  23.81 
 
 		 493 aa  94  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  23.81 
 
 		 493 aa  94  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.81 
 
 		 493 aa  94  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  23.81 
 
 		 493 aa  94  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  23.81 
 
 		 495 aa  94  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  23.81 
 
 		 493 aa  94  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  23.58 
 
 		 445 aa  94  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  23.81 
 
 		 495 aa  94  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.43 
 
 		 465 aa  93.6  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  24.56 
 
 		 441 aa  93.2  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  23.81 
 
 		 493 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  23.58 
 
 		 495 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.19 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  25.53 
 
 		 463 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.6 
 
 		 442 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.99 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.16 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.25 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  24.61 
 
 		 452 aa  87.4  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.99 
 
 		 464 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.83 
 
 		 450 aa  87  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.22 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.22 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.12 
 
 		 452 aa  86.7  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3585  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.73 
 
 		 484 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.01 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  23.65 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  26.7 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  21.97 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  21.97 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.92 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.13 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.29 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.52 
 
 		 874 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.41 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  23.93 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.43 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  24.12 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.41 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.9 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  23.29 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.54 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.07 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  23.19 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1726  secretion protein  24.22 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379002  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.05 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20050  putative outer membrane protein  24.22 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.7908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.91 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16260  Type I secretion outer membrane protein  22 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  20.63 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  22.09 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  22.09 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.38 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.02 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  24 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>